[求救] 有關於抽BAC以及PCR的問題

看板Biotech (生命科學)作者 (塵世中一個迷途小五六)時間10年前 (2015/04/15 02:17), 編輯推噓2(204)
留言6則, 4人參與, 最新討論串1/1
各位版友大家好 最近在抽BAC (約150KB) 遇到了一點障礙 首先 我是使用GENEAID的一般抽MIDI的KIT 但經過合作教授修改後在PROTOCOL上有些許的不同 首先我先養250ml的菌 隔夜後離心6000 去懸浮液後取細菌PELLET P1P2P3各加6ml 其中P2作用十五分鐘 P3也差不多作用15分鐘 (無VOTEX) 接著再將白色渣給離心離掉 取上清液直接加入isopropanol等體積沉澱並離心 接著用酒精wash後風乾 使用PEQ (通column的buffer) 回溶 最後將回溶完的液體拿去過column (已用PEQ通過) 並WASH 我最後PEL elute時將PELbuffer加熱到65度elute 再用同體積的isopropanol沉澱離心 最後回溶的DNA總量約是50-125ug左右 不知以上protocol是否有錯誤呢 另外還有PCR的問題 因為我想要在BAC上P出一段約2600BP的產物 因此我大概將30ng的DNA和PCR mix混合並跑35cycle 不過跑出來沒有結果 然後我也將細菌直接去做colony PCR 不過跑出來還是沒結果 老闆說是因為BAC低拷貝數量的關係P不出來 不過我colony PCR跑不出來還是第一次遇到就是了... 懇請各位先進解惑 多謝各位 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 1.163.68.240 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1429035474.A.706.html

04/15 04:10, , 1F
切一切看看??
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04/15 04:26, , 2F
我已前抽BAC,酒精wash完,風乾回溶後就沒過column,
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04/15 04:27, , 3F
不太清楚為何要過一次column?
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04/15 13:36, , 4F
試試PCR完再拿1ul做第二次PCR ??
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04/15 21:54, , 5F
先 P 個那 2600bp 內部的短片段看看是不是有產物。另外,GC
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04/15 21:54, , 6F
content 太高,也很容易amplify不出東西來。
04/15 21:54, 6F
文章代碼(AID): #1LBLdIS6 (Biotech)
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