[討論] Gal4/UAS 系統中 UAS 的位置

看板Biotech (生命科學)作者 (六百)時間10年前 (2015/06/30 14:09), 編輯推噓1(102)
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我是做斑馬魚的 最近想做 Gal4/UAS 的 transgenic fish 原則上是採用 Tol2kit http://tol2kit.genetics.utah.edu/index.php/Main_Page 以 three-insert multisite Gateway cloning 建構 plasmid (insert 1: UASx10, 2: coding region 3:poly-A signal) 其實也不算難 但是老闆想要更快,說不妨直接合成需要的序列丟進 destination vector 這樣做更輕鬆 老闆肯花錢我當然是爽 可是可是,問題來了: 標準的 three-insert gateway cloning 出來的結果, insert 跟 insert 間當然會夾一些剩餘的 recombinate site 之類的東西 (以我的目的來說就是 UASx10 跟 coding region 之間) 合成的 DNA 序列當然可以沒有這些 construction 的殘骸 但我卻擔心 UAS 跟 coding region 之間是否其實是需要一點距離的? 另外我的理解是一般的 promoter 已經內含 transcription start site (TSS) 但是 UAS 是 enhancer, 那麼 UAS 之後還需不需要外加 TSS 呢? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 96.32.146.15 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1435644573.A.12D.html

07/07 21:12, , 1F
一般來說不用 但是會有效率低的問題
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07/07 21:12, , 2F
有些人會在中間加kozac等加強轉錄效率
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07/07 21:13, , 3F
BTW 直接塞進去destination vector不是正規的做法
07/07 21:13, 3F
文章代碼(AID): #1LaZAT4j (Biotech)
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