Re: [求救] 有人做microRNA的嗎？

看板Biotech (生命科學)作者Fongshin (微笑曲線)時間9年前 (2016/01/07 21:17)推噓3(3推 0噓 5→)

留言8則, 4人參與討論串2/2 (看更多)

我這陣子也有在接觸miRNA，不過真的不是很明瞭，因為實驗室的一部分計畫有接觸人體試驗，當初是先收病患血液後，送去做次世代定序（Next Generation Sequencing, NGS)，分析出來的data，再利用學校的IPA 生物路徑分享軟體生物資料庫，去做分析（這部分我只上了一堂教育訓練，還是聽不懂）利用這軟體抓取相關的基因序列（？） Paper也會有寫序列調控哪些部分、相關，因當初這部分不是我做的，所以沒法清楚的告訴你，很抱歉一般會使用的網路資源還有 miRBase (http://www.mirbase.org/) 裡面會有你需要的序列，也會有相關性，不過聽業務說裡面大多為human和mouse，另外，ABI 自己後來有一個TagMan的資料庫，裡面還包含rat可用的部分由於我們實驗室也是才開始做這些部分，所以抽取miRNA都是使用Qiagen 的試劑（以前是諾貝爾公司獨家代理，現在原廠自己開立公司為凱杰）我現在使用上有問題會跟他們請教，當然也有很多公司可以問，只是剛開始還是會想問大廠的，不過Qiagen試劑不便宜，mi RNA用的也沒有大包裝可以買，剛開始可以先試看看，不過之後可以試著用小廠自己去合成需要的primer序列，除非你們實驗室很有錢......... 進階、凱杰、ABI(應該是併在萊富 invitrogen) 生工、基龍米克斯...等都可以問看看，最近跟我們有接觸的還有研毅公司另外那個NGS的部分，之前實驗室接洽的是威健生技公司，你都可以打電話詢問看看我只有這一點點小資訊，希望可以幫到你的忙 ※ 引述《whatupmen (jia)》之銘言： : 最近教授與醫院合作 : 開始接觸miRNA : 只是有個問題 : paper裡的miRNAxxx : 是如何找到？ : 還是用已知序列去設計 : 然後亂槍打鳥這樣？ : 還是有一套的sop ？ : 請做過miRNA大大指點迷津一下 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 59.115.135.156 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1452172661.A.0AF.html