Re: [求救] 請教discovery studio的高手

看板Biotech (生命科學)作者 (花)時間8年前 (2017/06/24 01:07), 編輯推噓0(000)
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※ 引述《t0953337796 (芋頭)》之銘言: : 我想利用Discovery Studio軟體中的protein-ligand interaction尋找蛋白及藥物 : 的對接 : 但小弟因為剛使用這個軟體 有很多地方不太會操作 : 想請教的問題有2個 : 1.這軟體所分析的結果哪項數值代表的意義是甚麼?(AbsoluteEnergy, ConfNumber : ,LibDock score, poses等等) Libdock的流程簡單分成Generate receptor hotspot, Generate ligand conformation, mapping with hotspot的步驟,有關conformation是指ligand的各種構型,pose是指liga nd mapping於hotspot的角度,score多指非共價鍵的接合能。分析數值根據你使用的Prog ram不同會有對應的結果,建議可多找找文獻從公式瞭解代表的意義。 : 2.我目前在用Discovery studio時只能一個一個藥物手動去給他跑,想請教要如何將我 : 要預測的藥物全部送給軟體,讓軟體自動一個一個幫我跑呢? 多個小分子化合物可集中於單一檔案中,input ligand選取該檔案即可進行多對一的計算 。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 114.136.230.57 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1498237650.A.52B.html
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