Re: [求救] 請教discovery studio的高手
※ 引述《t0953337796 (芋頭)》之銘言:
: 我想利用Discovery Studio軟體中的protein-ligand interaction尋找蛋白及藥物
: 的對接
: 但小弟因為剛使用這個軟體 有很多地方不太會操作
: 想請教的問題有2個
: 1.這軟體所分析的結果哪項數值代表的意義是甚麼?(AbsoluteEnergy, ConfNumber
: ,LibDock score, poses等等)
Libdock的流程簡單分成Generate receptor hotspot, Generate ligand conformation,
mapping with hotspot的步驟,有關conformation是指ligand的各種構型,pose是指liga
nd mapping於hotspot的角度,score多指非共價鍵的接合能。分析數值根據你使用的Prog
ram不同會有對應的結果,建議可多找找文獻從公式瞭解代表的意義。
: 2.我目前在用Discovery studio時只能一個一個藥物手動去給他跑,想請教要如何將我
: 要預測的藥物全部送給軟體,讓軟體自動一個一個幫我跑呢?
多個小分子化合物可集中於單一檔案中,input ligand選取該檔案即可進行多對一的計算
。
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