[求救] 急QQ想請問WGCNA的一些問題

看板Biotech (生命科學)作者inake24 (ggbear要提出來是我想的)時間7年前 (2018/04/01 16:40)推噓1(1推 0噓 2→)

留言3則, 2人參與討論串1/1

https://i.imgur.com/EPDcmi5.jpg

如圖作者從組織中找出基因後利用WGCNA還有還有其他生資的方法如GeneOtology或是IPA等等方法來對這些找出的基因做分析關於這張圖我的理解是作者把這些基因用表達量變化的pattern分為八大類把每一大類中主要參與的基因種類定義成各個function 並且從每一大類中找出最具代表性的example gene 但是問題來了（1）如果真照我想的為什麼function 那欄第2、5、6大類都叫做neuronal呢後面那個10^-7 10^-6 以及10^-5又是什麼意思（2） https://i.imgur.com/sUtTN82.jpg

後面作者說他把每一類的基因表達量作平均並用皮爾森係數來看每一類每一類的基因之間的相關度想請問這個做的目的是什麼（為什麼可以把數個基因表達量作平均之後才來比較，不是有正負之分嗎）圖的右邊有一個相關度為什麼只看正值呢我知道這個問題可能不難可是對於從未碰過相關領域的我真的是被搞的一個頭兩個大QQ 附上原文連結 http://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(18)30006-8 麻煩大家幫幫我了還有好多好多問題想問 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 1.34.55.79 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1522572026.A.B2A.html ※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 04/01/2018 16:41:16 ※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 04/01/2018 16:51:11

→

blence

04/01 16:54, 7年前 , 1^F

04/01 16:54, 1^F

是要報告的上面那些問題大多是先報告實驗室學長姐聽之後他們問的問題，我找不太到答案實驗室的領域是做動物實驗跟分生較多的所以比較不了解.. ※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 04/01/2018 17:23:11