[求救] 突變位點在發表論文中找不到已刪文

看板Biotech (生命科學)作者 (Inequality_c)時間4年前 (2020/12/03 14:02), 4年前編輯推噓4(407)
留言11則, 5人參與, 4年前最新討論串1/1
大家好,第一次發文 小妹雖然上了碩班但換題目之後真的實在不熟悉 請大大們編小力點(跪 目前我是在做DNA序列分析 從臨床檢體中找出point mutation的位點 但當我所有檢體做完後才發現.... 一支檢體裡面 光mutation的地方就非常多 (有跟wild-type序列比較過,也確定序列正確) 之後去統計了這些mutation佔的比例,大於50%以上才收錄 (因為如果不這樣可能30個位置都不夠我寫) 這基因總共有1000bp長左右 現在好了 老闆要我去找這些做出來的數據有沒有跟發表論文上的突變位置一樣 但不是差一就是.....幾乎沒有相同的 我不知道是我操作問題還是怎樣 但我確定送定序的訊號都是單一peak 求救學長姊們 拜託各位了(跪 是我的問題還是臨床檢體本身就有太多變數嗎? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 42.73.3.27 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1606975364.A.C51.html ※ 編輯: song4231 (42.73.3.27 臺灣), 12/03/2020 14:02:59

12/03 16:56, 4年前 , 1F
妳的檢體是什麼?體細胞?癌細胞?病毒?
12/03 16:56, 1F

12/03 16:56, 4年前 , 2F
知道什麼是 SNP 嗎?
12/03 16:56, 2F

12/03 19:00, 4年前 , 3F
你送plasmid嗎? 怎麼知道送定序的訊號是單一peak?
12/03 19:00, 3F

12/03 19:02, 4年前 , 4F
而且,你描述結果的部分很難懂
12/03 19:02, 4F

12/04 00:55, 4年前 , 5F
論文用HGVS各式記載突變會選擇RNA isoform,你有確認RNA
12/04 00:55, 5F

12/04 00:55, 4年前 , 6F
isoform跟論文是一致的嗎?
12/04 00:55, 6F

12/04 00:56, 4年前 , 7F
然後你的敘述50%是那個資料庫。這個比例很不可思議
12/04 00:56, 7F

12/04 01:26, 4年前 , 8F
檢體是甚麼? 你是做single cell seq 嗎?
12/04 01:26, 8F

12/04 11:26, 4年前 , 9F
你應該要先問 這30多個點是怎發現?
12/04 11:26, 9F

12/04 11:31, 4年前 , 10F
之前在南港,也遇過一樣的狀況,mutation超多,事後發現,可
12/04 11:31, 10F

12/04 11:31, 4年前 , 11F
能是enzyme導致的
12/04 11:31, 11F
文章代碼(AID): #1Vo7-4nH (Biotech)
文章代碼(AID): #1Vo7-4nH (Biotech)