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Re: [新聞] 抗老化權威林育誼為何輕生？

看板AfterPhD (博士後)作者 (是否)時間13年前 (2012/08/17 01:56), 編輯推噓27(27推 0噓 104→)
留言131則, 16人參與, 7年前最新討論串4/11 (看更多)
※ 引述《SmileFace (明天好天氣)》之銘言： : 在醫院，有一種生物叫做clinician scientist 恕刪 : clinician scientist，從一開始就決定了往後的孤獨... : ==================== : 以上只是個人感觸分享 : 請勿對號入座 這其實還好啦,沒那麼嚴重 也許您看到的例子讓你作出這樣的結論 我看到的則讓我有相反的結論 我認為clinician scientist吃不吃的開跟環境有關 就是如果這個環境"很需要"你的研究能力 你會如魚得水 以我以前待的醫院為例 A醫師,醫學中心內科某次專的主治醫師 他住院床數5床,但這不算特別少,因為該科的內規就是vs 五到十床 每天查房看病人5床加起來5-10分鐘就結束 也因為在醫學中心,所以實際臨床處置都由CR和R執行 病人常覺得vs不親切,常找不到人,但因為CR會幫忙看病人所以病人不會出什麼大事 有次他被病人投訴,主任去找他,他老兄大大方方說, "這是病人的問題,不是我的問題."連解釋也不解釋 主任也摸摸鼻子不能怎麼樣,因為他這幾年來一年至少發表5-6篇約3-4分的paper 科內大家搶著分他的光環 個人近距離觀察他在臨床:研究的比重約為10%:90% B醫師,同樣是醫學中心的次專主治醫師 在台灣念PhD時發了一篇nature xxxx 子刊 之後穩定經營自己的lab,去年再發了一篇nature xxxx (相隔約4-5年) 這中間大約維持1-2年發一篇oncogene,每年1-2篇小paper的速度 以上是指由他的lab產出的基礎paper 其他探討臨床治療等的paper就更多 (臨床paper發表速度本來就比基礎快) 他的作息大概是: 早上7:00查房,7:30晨會,8:00繼續查,9:00進實驗室, 跟學生討論啊寫paper等等,下午4:00再回去查一圈房 個人觀察他的臨床:研究比重約 30:70 C醫師,區域醫院主治醫師 在台灣念PhD,作的是transcription factor in cancer biology 之後重心放在臨床,但還是經營一個lab, 以作cancer patient genotyping/SNP/GWAS為主 (也就是不去碰cloning/cell model) 所以他的paper流程是: 找一個有可能的SNP-->拿大量patient sample去screen -->SNP correlate with survival/treatment response-->validate in tissue IHC 在衝刺副教授升等那幾年,他一年平均3-4篇paper,impact factor都是3-4上下, paper清一色都是SNP correlate with xxxx. 這種lab經營起來難度沒那麼高,基本上就是一直作PCR, IHC,就可以了 而他現在教授也拿到了,還當上某區域醫院(大學附設醫院)副院長. 這也算是clinician scientist啊 個人觀察他的臨床:研究比重: 20%:80% 以上的例子我還可以再舉3-4個,有一位在作某個病的angiogenesis,在yale作了幾年的 postdoc,回國後就有一個很成熟的angiogenesis mouse model in cirrhosis,她的臨床比 重大概也是20-30%,其他重心在lab 我是覺得clinician scientist孤獨與否是在有沒好環境,好長官,我覺得林醫師就是因為 太優秀,所以其他人都搶著要利用他的資源,這樣的環境確實讓人很不開心. 不知道這是不是台大醫院/醫學院的生態.... -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 137.131.236.158
推
08/17 08:05, , 1F
我覺得 GWAS 的 paper 大概有 90% 以上都是垃圾...
08/17 08:05, 1F
推
08/17 08:40, , 2F
GWAS是啥?
08/17 08:40, 2F
推
08/17 08:41, , 3F
Genome Wide Association Study
08/17 08:41, 3F
推
08/17 09:24, , 4F
當然是垃圾 allele或genotype基本上人生下來就不太會變了
08/17 09:24, 4F
→
08/17 10:07, , 5F
很難講,找到關鍵的SNP去correlate疾病預後其實在臨床上是有意
08/17 10:07, 5F
→
08/17 10:07, , 6F
義的,現在的問題是GWAS的study的false postive結論太多
08/17 10:07, 6F
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08/17 10:08, , 7F
所以上述兩位的推文我不反對,但應該修正成"GWAS的study多半
08/17 10:08, 7F
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08/17 10:08, , 8F
都是大量的垃圾偶而混雜著一點寶物"
08/17 10:08, 8F
→
08/17 10:13, , 9F
典型的例子就是日前上新聞的中研院陳垣崇院士,找到華人對
08/17 10:13, 9F
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08/17 10:13, , 10F
抗癲癇藥的過敏(有致死危機)的SNP,這現在已經在臨床上會拿來
08/17 10:13, 10F
→
08/17 10:14, , 11F
screening了 (原作: YT Chen, Nature 2004)
08/17 10:14, 11F
→
08/17 10:29, , 12F
research本質不就是一再重複地在垃圾堆中找寶物嗎?
08/17 10:29, 12F
推
08/17 11:04, , 13F
補充一樓，而且很花錢。
08/17 11:04, 13F
推
08/17 12:45, , 14F
90%太保守了吧 XD
08/17 12:45, 14F
推
08/17 13:28, , 15F
GWAS不是垃圾..但是要找到重點SNP或loci是挺碰運氣的
08/17 13:28, 15F
→
08/17 13:30, , 16F
而且跟比較方式為common/rare disease common/rare variant
08/17 13:30, 16F
→
08/17 13:32, , 17F
的scientific strategy有關.不過現在NGS抬頭,如果重覆過去
08/17 13:32, 17F
→
08/17 13:33, , 18F
的結果, 那應該還是有參考價值. 台灣GWAS的缺點在樣本過少
08/17 13:33, 18F
→
08/17 13:45, , 19F
NGS一直發展下去，SNP的研究就要變成第二個microarray..
08/17 13:45, 19F
推
08/17 14:13, , 20F
我本人就是clinician scientist.. 我只能說你看到的是
08/17 14:13, 20F
→
08/17 14:15, , 21F
表象..實際上很難不被凹 (不然醫院花錢請你來幹嘛?) 臨
08/17 14:15, 21F
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08/17 14:16, , 22F
床空間被壓縮也是必然, 您舉的例子有兩種可能, 一種是本
08/17 14:16, 22F
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08/17 14:17, , 23F
來就沒把主要心思在臨床上, 另一種是被壓到後來不得已才
08/17 14:17, 23F
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08/17 14:18, , 24F
坦然接受..圈子裡面的人是以後者居多
08/17 14:18, 24F
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08/17 16:32, , 25F
但是clinician scientist有paper也比較容易升官吧？
08/17 16:32, 25F
推
08/17 16:35, , 26F
想做GWAS...沒有足夠的資本還沒機會咧..能有做這種"垃圾"
08/17 16:35, 26F
→
08/17 16:36, , 27F
的能力也挺令人羨慕的 每次都要燒掉不少的錢
08/17 16:36, 27F
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08/17 16:38, , 28F
可以想見10年後，每個人出生15分鐘內就可以有whole genome
08/17 16:38, 28F
→
08/17 16:39, , 29F
sequence的建檔。到時候找SNP這個領域就真的消失了。:)
08/17 16:39, 29F
推
08/17 22:08, , 30F
找SNP這領域並不會因為WGS便宜而消失,反而會更多人做...
08/17 22:08, 30F
→
08/17 22:09, , 31F
SNP-disease最大的問題就在於這關係是combinatorial而非
08/17 22:09, 31F
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08/17 22:11, , 32F
1SNP to 1 disease, 2SNP to 1 disease. 只是這會是生資人
08/17 22:11, 32F
→
08/17 22:11, , 33F
的問題,不是clinical scientist收收sample,跑跑sequencing
08/17 22:11, 33F
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08/17 22:12, , 34F
就能解決的 光是現在大多clinical based的人只能抱硬碟哭
08/17 22:12, 34F
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08/17 22:19, , 35F
樓上說的真是，空有data卻沒有BioIT人才專門處理
08/17 22:19, 35F
→
08/17 22:23, , 36F
有錢跑NGS了，會分析的人才主要還在國外
08/17 22:23, 36F
→
08/17 22:32, , 37F
恩，我的意思是現在那些定序找SNP人會消失..取而代之的就是
08/17 22:32, 37F
→
08/17 22:32, , 38F
你們說的做生物資訊的人。
08/17 22:32, 38F
→
08/17 22:34, , 39F
但是哪些人有哪些疾病，還是要醫師才能進行呦。>_^
08/17 22:34, 39F
還有 52 則推文
推
08/18 13:33, , 92F
沒經過reverse genetics 和animal model驗證 找出mechanism
08/18 13:33, 92F
→
08/18 13:35, , 93F
都是不可信的 因為這些工作量很龐大 我們不在乎差異1 2倍的
08/18 13:35, 93F
→
08/18 13:36, , 94F
變化 我們只會找差異最明顯的一兩個出來作實驗..
08/18 13:36, 94F
推
08/18 13:41, , 95F
真的重要的gene or snp 一個就送你上cell
08/18 13:41, 95F
→
08/18 13:42, , 96F
100 potential hits, 還是只能去plos one...
08/18 13:42, 96F
推
08/18 13:48, , 97F
回momo 你說得對 但是PCR只是一個工具 不是一個很大的領域
08/18 13:48, 97F
→
08/18 13:51, , 98F
早其作環境微生物的人 可能對改進PCR技術還有興趣 但現代hig
08/18 13:51, 98F
→
08/18 13:51, , 99F
h throughput single cell pcr 出現以後
08/18 13:51, 99F
推
08/18 13:54, , 100F
研究pcr的人就會越來越少囉
08/18 13:54, 100F
推
08/18 14:31, , 101F
p大有理 做wet lab 常只會和一條大魚盯孤支而已
08/18 14:31, 101F
→
08/18 18:58, , 102F
懷疑p兄沒碰過GWAS,不然就不會舉cell當例子,GWAS霸佔nature
08/18 18:58, 102F
→
08/18 19:00, , 103F
genetics一半以上,顯然不是你用wet/dry lab這樣的二分觀點
08/18 19:00, 103F
→
08/18 19:19, , 104F
GWAS的研究源自生統,怎麼樣不會有外面公司做這種paper發表
08/18 19:19, 104F
→
08/18 19:29, , 105F
microarry, RNAi, 更早期的est library也霸佔過nature阿..
08/18 19:29, 105F
→
08/18 19:43, , 106F
doi:10.1038/ng0710-558
08/18 19:43, 106F
→
08/18 19:44, , 107F
最後一段
08/18 19:44, 107F
推
08/18 22:40, , 108F
回PCR該段.LAMP是PCR的新章.這對田間調查的便利性突破天際
08/18 22:40, 108F
→
08/18 22:41, , 109F
dUTP的出現也提高PCR的敏感性.光是如何好好作PCR就有學問在
08/18 22:41, 109F
→
08/18 22:41, , 110F
怎麼P大還是覺得PCR只是小朋友的香菇泡湯遊戲呢??
08/18 22:41, 110F
→
08/18 22:43, , 111F
希望眼界跟實力不要僅止於此.生科領域是很廣大的 啾咪~*
08/18 22:43, 111F
→
08/18 23:41, , 112F
什麼是香菇泡湯？
08/18 23:41, 112F
→
08/18 23:42, , 113F
另外我也同意近來nat genetics根本就被GWAS淹沒
08/18 23:42, 113F
→
08/18 23:42, , 114F
常常看標題覺得很有趣但讀了只是更困惑，因為通常就是我們用
08/18 23:42, 114F
→
08/18 23:43, , 115F
了blah blah blah方法找出跟這個gene interaction的有300
08/18 23:43, 115F
→
08/18 23:43, , 116F
個最相關的gene，然後又blah blah blah validate得到了
08/18 23:43, 116F
→
08/18 23:44, , 117F
200個gene，其中我們稍為探討一下其中最有趣的一兩個gene ..
08/18 23:44, 117F
→
08/18 23:44, , 118F
然後文章就沒了@___@
08/18 23:44, 118F
推
08/18 23:58, , 119F
去年參加了nat genetics的研討會. GWAS最煩的是.作完後很難
08/18 23:58, 119F
→
08/19 00:00, , 120F
validate-_-"換到mouse model.又沒辦法搞出病來(genetic咩)
08/19 00:00, 120F
→
08/19 00:01, , 121F
疾病的討論. 我想大概還是寄託在RNAseq吧@@.不過更難 XD
08/19 00:01, 121F
→
08/19 00:05, , 122F
香菇泡湯是亂講的, 就eppi放水浴槽.三溫暖一下就有產物了
08/19 00:05, 122F
→
08/19 00:07, , 123F
題外話T_T eQTL應該也有潛力.. 可是好難推呀 XD
08/19 00:07, 123F
推
08/19 03:40, , 124F
推jabari~Please be open-minded and respect every
08/19 03:40, 124F
→
08/19 03:42, , 125F
scientific field!BTW,eQTL主要的問題還是microarray雜訊
08/19 03:42, 125F
→
08/19 03:43, , 126F
太多,所以最上游wet lab的實驗還是很重要的 羊毛出在羊
08/19 03:43, 126F
→
08/19 03:44, , 127F
身上 如果收到的DATA不好 其實下游的電腦分析者也很難做
08/19 03:44, 127F
→
08/19 03:47, , 128F
出好結果(統計老師常說:garbage in, garbage out XD)
08/19 03:47, 128F
→
08/19 03:48, , 129F
一開始的實驗設計 準備sample 其實是非常關鍵的一環...
08/19 03:48, 129F
→
11/11 20:48, , 130F
的結果, 那應該還是有 https://noxiv.com
11/11 20:48, 130F
→
01/06 21:35, 7年前 , 131F
GWAS是啥? http://yofuk.com
01/06 21:35, 131F
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