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看板BioMedInfo (生醫資訊)作者HIbaby (燃燒吧! 嗨~北鼻!)時間17年前 (2008/05/31 11:08)推噓0(0推 0噓 0→)

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※ [本文轉錄自 Acad_discuss 看板] 作者: realism () 看板: Acad_discuss 標題: [政見] BioMedInfo 板時間: Fri May 30 19:05:46 2008 做一點補充: 近幾年來無論國內國外漸漸開始把生物資訊改稱為生物醫學資訊 (e.g. Bioinformatics Institute --> Biomedical Informatics Institute) 細看這個名詞可以發現生物到醫學即是基礎到臨床這個領域便是希望藉由資訊技術整合兩個點為線進而加速其發展此版已此為名當然也是希望更多在這條線上的人們可以藉由這個版凝聚不同領域的共識創造互通互信的語言更能找到為彼此連結的那條線 ※ 引述《huggie (huggie)》之銘言： : 政見 : 生物醫學資訊是一個相對新興、跨領域的學門。國內投入此領域已有數年， : 但也許是這個領域人數不多的緣故，缺乏專屬溝通的平台。過去其實也曾經 : 有生物資訊專門論壇設立，但知道的人不多，參與的人更少。其實除了生醫 : 資訊人以外，今日的生物人在研究中，也往往不脫廣義的生物資訊的範疇。 : 何謂生物醫學資訊？生物醫學資訊是藉由資工、統計、數學、生化等來研究 : 生物以及醫學的議題。在生物學方面，在三千多個物種的基因體定序完成的 : 今日，以及各種高通量實驗資料的出現，對於進一步了解生物學提供了機會 : ，但也造成了分析上的困難。在醫學方面，隨著各種基礎設施的建構，加速 : 了對於各種臨床數據的蒐集，也希望能對這些資料進行分析，歸納出對於診 : 斷以及治療有用的資訊。本質上似乎這是兩個議題，但共同的是，希望藉由 : 跨領域的人才一起研究一堆看似雜亂無章的數據，提出進一步的假設。 : 生物資訊具體的分析在參考 Wikipedia 以及 Bioinformatics.org 之後， : 或許可以粗分成以下幾類（概略的分法，各領域之間有不少重疊部份）： : 序列分析/比較基因體學 (Comparative Genomics) : 基因註解 (Genome Annotation/Gene Finding) : 資訊演化生物學 (Compuational Evolutionary Biology) : 基因表現分析 (Analysis of Gene Expression) : 蛋白質表現分析 (Analysis of Protein Expression) : 功能性基因體研究 (Functional Genomics) : 蛋白質體學 (Proteomics) : 結構基因體學 (Structural Genomics) : 系統生物學 (Systems Biology) : 醫學資訊則牽扯到基礎建設的建立，例如蒐集並且處理資料，以及對這些資 : 料做進一步的推論。由於本人（huggie）對這方面不是非常的了解，因此先 : 且略過。有待於對醫學資訊琢磨較深的板友來補充。 : 以上是較詳細的定義，但廣義的來說，任何藉由電腦來處理生物或醫學資料 : 的方法即是生醫資訊。舉凡資料的存取、分析、以及預測，皆為生醫資訊的 : 一種應用。因此，我想不只生醫資訊人能受益於此板的討論，也希望生物人 : 能多多利用這個平台，只要不是單純 wet bench 實驗上面的問題，牽扯到 : 工具方面的使用，就是本板的好問題。 : 因此，本板的討論範圍很廣泛，暫分為以下幾項： : 1. 工具 : 網路資源例如 NCBI、PDB 以及各式資料庫，或者分析工具例如 BLAST、 : Sequest等，凡是在研究中所遇到的，工具上的使用皆為此類。 : 2. 程式 : 生物資訊傳統上比較常用的程式為 Perl 與 Java ，但其他工具如 C， : Python 等使用的人也不少。凡程式方面，比較需要生物背景知識相關 : 的，例如相關套件使用（BioPerl，BioJava，BioPython 等），或者是 : 比較基礎的程式問題皆規於此類。 : 3. 用語 : 由於是跨領域的學科，許多人背景另有專攻，剛接觸這個領域時不免對 : 於一些簡單的基本英文用字有不少障礙，看期刊頗有困難，普查字典也 : 不得其解（本人曾深感其苦，現在也尚未完全解脫）。希望生物背景較 : 扎實的板友能為初踏入此領域的人解惑。相對地，生物背景在接受資訊 : 方面的訓練的時候或許也有類似困擾，也希望大家能傾囊相助。 : 4. 其他研究問題 : 各子領域都有其研究上面的問題，凡與生醫資訊此大傘相關，dry lab : 實驗的問題，都適用於此板。 : 5. 消息 : 鑑於生醫資訊方面討論的很少。本板除了作為一個問答的論壇以外，也 : 希望板友能提供最新的消息以及知識。不論消息來源是新聞，還是最近 : 發表的期刊，或者來自於研討會的演講，都可以提供消息，亦或可加入 : 一些個人看法以及心得，提昇討論的風氣，刺激板友新的想法與新做法 : 。希望本板能在論壇之外，作為一個蒐集新聞的平台。 : 6. 會議 : 若有相關的研討會，課程以及講習營等消息，只要是開放外界參加的， : 也希望大家提供給有興趣的人知道。 : 因為個人背景的關係，以上討論也不免偏好生資方面，希望有醫資方面的人 : 才來一起參與。另外，本板原本是要由 realism 發起，無奈文章數不夠， : 目前仍在衝文章數中，因此由本人代為發起。不過，我是真的才疏學淺（非 : 自謙），望能拋磚引玉，也希望大家能對於本板板務提供一些意見，謝謝！ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.77.166 ※ 編輯: realism 來自: 140.129.77.166 (05/30 19:18) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 133.11.198.91