[問題] Construct Phylogenic Tree
我想請教大家一下有關於畫親緣樹的問題
一般來說是不是都要有一個root???
例如我的序列是1984-2007
那我需不需要挑兩三條1920 1930 1940之類的outlier來當root??
還是其實只要一條就夠了???
另外如果今天要看A 血清型 跟B C血清型(就是畫在同一棵樹上的話)
那我是不是要ABC三種都挑一株當作root? 還是說只要挑個A當root呢???
再請問一個align的問題
有分global 跟local alignment
我要如何選擇要global還是local align?
還是說global align 好之後 把認為沒有對好的地方切下來再align呢??
謝謝大家~^^
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推
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