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看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (燃燒吧! 嗨~北鼻!)時間16年前 (2008/06/17 12:22), 編輯推噓6(6推 0噓 10→)
留言16則, 5人參與, 最新討論串1/4 (看更多)
最近手邊多了很多大量microarry data. 不外乎就是很多基因的ID碼 或是一些基因的縮寫. 不知道有沒有一些小軟體, 可以把excel上面這些ID直接連結到資料庫 或是轉換成全名? 如果有這樣的東西, 那就非常方便了 -- 專業. 清新. 新知. [ 了解疾病成因, 了解您服用的藥物 ] ● 醫學生物學研究院 ● ● PTT 藥學研究院 ● 全部都在 國家研究院 > 科學學術 > 生醫研究院 中! >>>>>>>> <<<<<<<<<>>>> PTT medicine PTT pharmacy <<<<<<<<<>>>>>>>> << -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 133.11.70.111
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06/17 13:07, , 1F
excel的話 應該可以寫VB script去達成你的要求 或是你
06/17 13:07, 1F
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06/17 13:09, , 2F
先將其另存成csv檔後 自行用perl或php python去抓囉~
06/17 13:09, 2F
推
06/17 13:31, , 3F
轉換資料可以參考ftp://ftp.ncbi.nih.gov/gene/DATA/
06/17 13:31, 3F
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06/17 13:31, , 4F
內的GENE_INFO 有ID SYMBOL DESCRIPTION 等資訊
06/17 13:31, 4F
推
06/17 16:55, , 5F
有mesamonster提供的這個.我倒是有個粗糙的程式可以把它跟
06/17 16:55, 5F
推
06/17 16:55, , 6F
你 excel 存成 tab delimited file 之後的東西join在一起
06/17 16:55, 6F
推
06/17 22:21, , 7F
如果你會perl->Ensembl API + SpreadSheet(from CPAN)
06/17 22:21, 7F
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06/17 22:22, , 8F
可以google一下 documents也寫很清楚
06/17 22:22, 8F
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06/18 12:53, , 9F
謝謝... 我研究看看^^
06/18 12:53, 9F
推
06/18 14:10, , 10F
如果真的不會 我可以貼我的code含註解給你看 很easy的
06/18 14:10, 10F
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06/18 15:59, , 11F
^^ 樓上是好人
06/18 15:59, 11F
推
06/18 16:44, , 12F
Hibaby對程式有研究嗎?
06/18 16:44, 12F
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06/19 07:28, , 13F
目前沒有^^ 素人一個, 不過有興趣接觸. 可能要過一陣子^^
06/19 07:28, 13F
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06/19 12:26, , 14F
我最近比較忙一點 我註解好再貼上來吧...
06/19 12:26, 14F
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06/19 12:27, , 15F
我的code不寫註解... 你會看到吐白沫=.=
06/19 12:27, 15F
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06/19 12:28, , 16F
我是那種寫程式 過個一陣沒去改 就會忘記自己寫啥的人XD
06/19 12:28, 16F
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Re: [討論] 小程式
soom
16年前, 06/19
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排序： 最舊先 | 最新先 | 留言數
6
16
[討論] 小程式
HIbaby
16年前, 06/17
2
2
Re: [討論] 小程式
soom
16年前, 06/19
1
2
Re: [討論] 小程式
kawuru
16年前, 06/19
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