Re: 為何我的6xHis-protein在nickel column拉梯度之初,就被洗出來!
※ 引述《wuko.bbs@bbs.nsysu.edu.tw ()》之銘言:
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> 為何我的6xHis-protein在nickel column拉梯度之初,就被洗出來?
> 我利用大腸桿菌來表現6xHis-protein,
> 經過IPTG誘導後,
> 破菌!
> 將上清液灌入nickel column,
> 在wash時, 沒事!
> 但是在0~500 mM imidazole拉梯度(二十倍體積)之初,
> 我的6xHis-protein 在一開始(一倍體積)體積, 就被洗出來!
> 所以我的nickel column拉梯度圖,
> 就在最前面只出現了一根很大根的peak!
> 然後就持平到最後,
> 經過western blotting分析後才發現,
> 我的6xHis-protein在前面這根很大根的peak裡面,
> 但是這根很大根的peak裡面還伴隨著數百種蛋白質,
> 請問怎麼會這樣呀?
有幾種可能
1.你把His tag接在protein的哪一端?
在N-ter的話因為它是先被製造出來的,所以很可能folding時被包進去了,造成binding能力不足.建議接在C-ter
2.設計時的問題
若His tag本身離protein太近也會造成tag無法隨意飄動,或幅度太小,建議可於prtein與tag間加上一個cutting site (ex:factor X)反正也方便將純化後的tag切掉,或者是多接一點His,我一般都用10個His喔
3.實驗準備上的問題
你的column用了多次的話就應該要re-charge,或column中的EDTA或imidazole是否有清洗乾淨.再者你的所有buffer是否有會干擾實驗的物質,或你的梯度拉的太快,loading時流速過高,都會有所影響喔
4.命不好
其實做蛋白質實驗常常會是聽天由命的,表現量,純化結果等等.基本上本人也發身過許多次.但基本上盡力而為囉
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