Re: [問題] proline

看板Biology (生物學)作者vocaline (vocaline)時間18年前 (2008/04/07 18:08)推噓1(1推 0噓 0→)

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首先蛋白質的二級結構分為α螺旋(α helix)和β摺板(β sheets) 先看α helix的鍵結而在α helix中，並非所有多肽鏈均能形成穩定的α helix 胺基酸支鏈間的交互作用可能造成整體結構的穩定與不穩定例如:如果一個多肽鏈有一個部份都由Glu組成，那麼這一段在pH=7.0時就無法形成αhelix αhelix的扭曲使得一個胺基酸和兩旁第三(有時是第四)個胺基酸的支鏈之間可以交互作用距離帶負電的胺基酸三個胺基酸遠的通常是帶正電的胺基酸這樣兩者之間可以形成離子鍵芳香族的胺基酸也常常這樣排列，形成疏水性的交互作用。而Pro的出現會限制α helix的形成 Proline中的氮原子是五元環的組成之一，這使得N-Cα無法旋轉。所以Proline會造成αhelix的 kink(扭結)。除此之外，Pro中的氮原子也沒有可與其他單元形成氫鍵的氫原子。因為以上原因，Proline在α helix中極少見。而相反的在β sheet中 Proline則是常常出現因為imino的氮原子構成的胜肽鍵(peptide bond)已經是順式(cis)的構形這樣有利於一個較直接的轉折(βturn)的形成。Ｏ R H || \ / R-C H C \/ / \ /\ C - N | // \/ Ｏ cis(順式)的 Proline 希望我對於你的提問沒有看錯，也希望有幫上忙~~ ※ 引述《appl (彰)》之銘言： : 【問題】： proline在一般蛋白質摺疊中扮演什麼角色有什麼特別的地方 : 【問題起因】：PAPER : 【個人看法】：與PPIase有關但不知為什麼作者強調proline與 protein folding的 : 關係 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.62.1