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Re: [問題] 我想請問有關alternative splicing

看板Biology (生物學)作者 (Keep Working)時間17年前 (2008/08/08 22:33), 編輯推噓1(1推 0噓 6→)
留言7則, 1人參與, 最新討論串3/3 (看更多)
※ 引述《boblu (六百)》之銘言： : 抽 mRNA 跑 northern, 同一個 probe 會染到多條不同分子量的 band : 抽 mRNA 跑 RT-PCR, 同一組 primer 會跑出不同大小的產物 : in situ 要怎麼看啊？一時想不出來說 in situ 我也不知怎麼看 第三個方法可以用RNase protection assay -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 219.81.144.101 ※ 編輯: MrCAKE 來自: 219.81.144.101 (08/08 22:35)
推
08/11 19:07, , 1F
in situ比較像事後confirm用 先知道spliced region之後
08/11 19:07, 1F
→
08/11 19:08, , 2F
再設計會hyb到那段的probe。這段probe就會黏不上去
08/11 19:08, 2F
→
08/11 19:09, , 3F
但是在表現full-length的細胞中卻可以有訊號
08/11 19:09, 3F
→
08/11 19:09, , 4F
另外你還需要一組probe會黏到full-length和spliced form
08/11 19:09, 4F
→
08/11 19:10, , 5F
都存在的region 來證明你的目標細胞有表現這個gene
08/11 19:10, 5F
→
08/11 19:11, , 6F
其實還有一個生資的方法~~利用EST去預測可能的splicing
08/11 19:11, 6F
→
08/11 19:13, , 7F
RT-PCR之外也可以搭配5'RACE以及3'RACE一口氣解決
08/11 19:13, 7F
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