[問題] Sub-cellular localization網站

看板Biology (生物學)作者 (唉呦)時間8年前 (2016/11/15 20:40), 8年前編輯推噓1(102)
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請問我想找關於基因表現出的蛋白 在細胞中的位置 除了GeneCards和 Human protein Atlas之外 有更好的網站有標出Sub-c ellular localization嗎 謝謝! BTW 我還想問 Metacore/IPA等大資料庫中的Subcellular 是準的嗎 有些基因在網站跟軟體中寫的位置 不太一樣欸 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 101.12.135.167 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biology/M.1479213657.A.498.html ※ 編輯: over999 (101.12.135.167), 11/15/2016 20:50:20

11/15 21:43, , 1F
會這樣問是因為你不相信genecards與protein atlas嗎?
11/15 21:43, 1F
主要是因為Atlas資訊很模糊 只會顯示 核/胞內/膜/胞外 有些膜蛋白我沒辦法看出來是 內膜蛋白還是穿膜/外膜蛋白 GeneCards則是用評估值 膜5分/質4分/骨架5分/核3分 有時候遇到膜 核都五分 就不知道是核膜還是細胞膜 所以我現在都是結合網站及軟體 再找paper 但是我的基因數量有點多 想說有沒有比較有 效率的方式 ※ 編輯: over999 (101.12.135.167), 11/16/2016 09:28:18 ※ 編輯: over999 (101.12.135.167), 11/16/2016 09:30:10

11/16 23:07, , 2F
GO enrichment分析是你最簡單的解
11/16 23:07, 2F

11/18 03:51, , 3F
kegg IPA基本上就是人家幫你唸過paper啊 自己確認吧
11/18 03:51, 3F
文章代碼(AID): #1OAm9PIO (Biology)
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