Re: 請問要去哪抓所有人類蛋白質序列的資料呢?
※ 引述《ubiquitin (幸福金金幸福)》之銘言：
> 我想抓所有蛋白質序列來分析
> 之前有試過以 swiss prot 連結 UniProt
> http://www.expasy.uniprot.org/database/download.shtml
> 但是抓下來的fasta 檔案似乎是所有生物的
> 我用手提電腦跑 perl 寫的程式
> 結果記憶體不夠....
> 所以想先抓所有人類的蛋白 fasta 檔就好
> 只要人類蛋白的
> 敘列名稱和氨基酸序列
> 請問眾大大們
> 要去去哪抓呢?
同一個網頁，
畫面的左側有一個聯結可以通向UniProtKB的ftp
ftp://ftp.expasy.org/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/
進去以後選taxonomic_divisions資料夾
在裡面就有uniprot_sprot_human.dat.gz跟uniprot_trembl_human.dat.gz
兩個檔案，可以自行選擇需要的檔案
希望有幫到你..
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