Re: [問題] 病毒論文的實驗

看板Biotech (生命科學)作者 (waiting for good news)時間19年前 (2006/04/16 02:30), 編輯推噓1(101)
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非常感謝您肯花這麼多時間幫我看原文, 還有用心回答 :) 我還有一個問題想請教您, 麻煩您了 :P 實驗中分別使用ICP0 viral promoter及integrated ICP0 promoter的vector和plasmid, transfect到細胞中, 之後再用HSV-1感染並觀察NF-kB被吸引到哪些promoter上. 我的問題是, fig5A (http://tinyurl.com/jsy48)的圖片介紹提到: 上面那個是ICP0 viral promoter, 下面的是intergrated viral promoter, (箭頭所指的方向代表primer的位置). 但我不懂, 為什麼這樣序列的安排稱作 ICP0 viral promoter及intergrated viral promoter? 我完全不曉得要從哪裡去瞭解它, 是否可以麻煩請您給我一些指引呢? * fig 5 : http://tinyurl.com/ghkat ※ 引述《blence ( )》之銘言: : Herpes simplex virus disrupts NF-κB regulation by blocking its recruitment : on the IκBα promoter and directing the factor on viral genes : 從文章標題知道,HSV阻斷NFKB的能力(活化IKB) : 是利用病毒本身的基因(ICP0)將細胞內的NFKB全部吸引過來 : Viral ICP0 Promoter Shows Remarkable Avidity for NF-kB : 這部分的實驗在說明病毒的基因能吸附NFKB : 是病毒本身的ICP0 promoter (ICP0p)幹的 : 所以實驗先證明NFKB可以結合在病毒ICP0p與IKBp上(一開始,第1時間點) : 第2時間點時,NFKB只結合在病毒的ICP0p上 : (那是不是病毒對於ICP0p的親和力比IKBp高?) 不是 : 因為如果把ICP0p弄到stably integrated cells(HaCaT-ICP0-Luc) : 即把ICP0p放到跟IKBp一樣都在染色體上,NFKB對於這兩個就都不喜歡了 : 在這時候NFKB還是比較喜歡在病毒基因上,自由自在的ICP0p : 而不是被染色體包覆的ICP0p或IKBp : 因此作者推測HSV的感染,引發染色質chromatin全面性的改變或修飾 : 使得原本IKB promoter可以讓NFKB結合的位置變得難以靠近 : (而HSV也順勢將無處可歸的NFKB抓到自己的ICP0 promoter上面來) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.60.111

04/16 13:45, , 1F
請參考CHIP:chromatin immunoprecipitation,了解這實驗方法
04/16 13:45, 1F

04/16 13:46, , 2F
應該就很懂為什麼有F-a的兩對primer及c-e的實驗結果的意義
04/16 13:46, 2F
文章代碼(AID): #14GJlFOF (Biotech)
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