[問題] 請問是否有可以了解INTRON的網站

看板Biotech (生命科學)作者 (生化...go go go !!)時間19年前 (2006/11/13 13:42), 編輯推噓8(806)
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請問是否有可以了解自己設計的primer是否有跨過INTRON的網站 例如說 輸入自己的PRIMER之後就會顯示你設計的PRIMER位於何處? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.64.49.5

11/13 14:29, , 1F
你自己設計的primer不是照著序列找的嗎 怎會不清楚位置呢
11/13 14:29, 1F

11/13 14:29, , 2F
怎麼可能會不知道有沒有跨intron呢 不太懂你的問題
11/13 14:29, 2F

11/13 17:12, , 3F
可能他是從cDNA設計..但不知道exon的接合處...
11/13 17:12, 3F

11/13 17:13, , 4F
如果是RT-PCR就沒關係了..從genome去PCR就有差
11/13 17:13, 4F

11/13 18:32, , 5F
這很簡單,找cDNA和genomic DNA 序列對一下就知道了
11/13 18:32, 5F

11/13 23:34, , 6F
3F說的隊.我當然是從cDNA去夾阿.
11/13 23:34, 6F

11/13 23:36, , 7F
想請問要如何知道此gene的genomic DNAㄋ
11/13 23:36, 7F

11/14 00:05, , 8F
有一個網站很好用http://www.ensembl.org/index.html
11/14 00:05, 8F

11/14 00:06, , 9F
這應該是做分生人的必備 要好好研究一下
11/14 00:06, 9F

11/14 00:22, , 10F
如何知道?!當然是從NCBI找阿
11/14 00:22, 10F

11/14 14:33, , 11F
J我想我說的不好.大家都不太了解我的意思
11/14 14:33, 11F

11/14 14:34, , 12F
我的意思是.我鍵入primer後就可以直接告訴我位於哪個exon
11/14 14:34, 12F

11/14 14:35, , 13F
如果是從Cdna去釣.很複雜!不好意思讓大家誤會~
11/14 14:35, 13F

11/15 02:52, , 14F
blast in UCSC genome Bioinfo, or blast in Ensembl
11/15 02:52, 14F
文章代碼(AID): #15M0M_l2 (Biotech)
文章代碼(AID): #15M0M_l2 (Biotech)