Re: [請益] 關於基因專一性探針的問題(gene-specif …
※ 引述《transmore.bbs@ptt.cc (小次郎)》之銘言：
> ※ [本文轉錄自 Biology 看板]
> 作者: transmore (小次郎) 看板: Biology
> 標題: [請益] 關於基因專一性探針的問題(gene-specific probe)
> 時間: Mon Apr 30 22:05:46 2007
> 因為實驗的需要
> 我要設計專一性的探針
> 用來分離、確認相似度非常高的基因(植物的gene family)
> 相似度高到約1000bp的基因只有約5個mer的差別
> 要找出大片段的差異區來設計probe是不可能的
> 但是如果在20bp的區域中有兩個mer的差異
> 這樣的probe能分辨不同的基因嗎?
> 舉例來說
> 如果我有兩段序列如下
> 1.***********GATGGTAGAGTGATACAGAC****************
> 2.***********GATGATAGAGTGATTCAGAC****************
> ^ ^
> *表示完全相同的序列
> 如果我設計的probe是與1號序列完全配對的20個mer
> 用這樣的probe去篩選時
> 會黏到2號序列嗎?
> 又..如果會黏
> 我加高wash的溫度..可以讓他從2號序列洗下但還是黏在1號序列上嗎
> 如果加高溫度是可行的
當然是可以的
用計算去求Tm只能參考
因為會受鹽濃度影響
比較精確的方法是去跑real time PCR
這種機器有分析DNA Tm的功能
--
※ Origin: 生命科學 BBS <bbs.life.nthu.edu.tw>
◆ From: 61-59-139-151.adsl.static.seed.net.tw
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