[問題] 關於檢測突變的方法

看板Biotech (生命科學)作者 (Egg Dance)時間19年前 (2007/06/13 06:28), 編輯推噓0(000)
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這兩天唸一篇paper,是要看cancer cell mitochondrial DNA突變 (ND4 mutation in transitional cell carcinoma: Does mitochondrial mutation occur before tumorigenesis? C.Y. Tzen,Mitochondrion,2007,273-278) 作者用了三種方法來檢查: DNA sequencing RFLP DHPLC(denaturing HPLC) 而文中提到,三種方法的sensitivity是定序最低,RFLP其次,DHPLC最高 我想,sensitivity是指只需少量sample就能有結果吧 a.但如果在知道mtDNA序列的情況下,用PCR放大不就沒有sensitivity高低的疑慮 還有,既然要找突變,那檢查的正確性應該比較重要 我以為定序應該最正確,因為兩個序列一對馬上就知道哪裡突變了 b.問了朋友,說定序很容易出錯,但他也不會解釋,請問是為什麼呢? 然後這個朋友一直跟我說,和定序相比,RFLP就可靠多了 c.但我覺得,要是突變不是發生在切位上的話根本就檢查不出來阿,怎麼會比較正確? 三種方法都只是學過原理,並沒有實際操作過的經驗 以上共三個問題,麻煩懂的人解答了,謝謝!... -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.117.199.96
文章代碼(AID): #16Rnu1Vp (Biotech)
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