Re: [求救] 為甚麼IP時,將Ab和beads cross link可 …
※ 引述《ligase (真的不是距離)》之銘言:
: ※ 引述《boblu.bbs@beta.life.nthu.edu.tw (六百)》之銘言:
: : IP 的時候 crosslink 不會減少 ab 的 heavy chain 和 light chain
: : IP "western" 的時候才會減少偵測到的 heavy chain 和 light chain
: : 另外 如果你不是來抄作業的
: : 好歹說一下為什麼會想問這個問題
: 我不是來抄作業的
: 因為我現在做實驗遇到這個問題
: 但是前人以及我在網路上找到的其中的方法是可用DMP做crosslink
: 我很努力找為甚麼可以降低的原因
: 可是真的不知道為甚麼
: 所以才發問的
: 不好意思 沒有交代前因後果
: 讓你誤會了
: 謝謝你
因為透過crosslink將Ab接到beads上,
就等於將Ab的heavy chain,連同light chain(在non-reducing的情況下)
固定在beads上面;
這樣就可以在IP過程最後的elution步驟中,
大幅減少Ab的light chain及heavy chain自beads上elute出來的量。
也因此可以降低heavy chain及light chain對最後elute出來的IP sample所造成的汙染。
順帶一提,
為何要用DMP呢?
其實用其他的crosslinker也不是不可以,
但是DMP有個好處:
他的官能基: imidoester在與primary amine反應後會帶positive charge,
因此在DMP對protein上的primary amine (大部分是lysine)進行反應後,
該位置的residue仍會保持原來的電性;
這樣就可以減少Ab因為受到crosslinker造成的電性改變引發的對抗原affinity降低。
但是,實際用哪種crosslinker最好,還是得透過實驗驗證最為穩當,
畢竟不是每種Ab或beads都適合同樣的crosslinking condition......
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 123.195.10.33
推
08/17 23:17, , 1F
08/17 23:17, 1F
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