Re: [求救] 抽DNA跟跑電泳的問題
※ 引述《yaliu (雅)》之銘言:
: ※ 引述《hsin1106 (過於喧囂的孤獨)》之銘言:
: : 最近剛進實驗室開始做實驗
: : 在抽DNA跑agarose gel時碰到了幾個問題
: : 1.我的gel照UV的時候 頂端會整個偏白色
: : 比較上面的band會被蓋過去 不容易判讀
: 會不會buffer太髒,或者gel配太久了??
gel都是 現做的 1%
buffer的話是公用的
: 如果片段太大可以降低agarose %數
: : 2.用BamH和NdeI切我的plasmid時
: : 我的比例是 兩種酵素 各加1μl
: : DNA 7μl 跟 1μl 10X 的buffer
: : DNA量比較多的話就等比例增加
: : 之後再37度下反應兩個小時
: : 可是跑完電泳 甚麼都看不到
: : (marker跟未切拿來當control的都有band)
: 各loading的量?
: 未切的和已切的各loading多少?
通常我都會loading一樣的量
loading過10μl跟20μl兩個量
: : 3.我的plasmid 是pET-15b
: : 通常在菌液OD=1.5上下時用VIOGENE的kit抽
: : 抽出來的DNA稀釋10倍測260nm大概都在0.03~0.05之間
: : 這樣的量是不是偏少?? 是的話 有哪些可能會影響??
: 濃度應該用核酸測定儀測吧
: 不然可以對照marker的量
: 記憶上以前測過1mL的菌液萃取,好像頂多0.6~0.9 ug/ul吧
: 好像很難超過 1ug/ul (不曉得有沒有記錯.....)
: 我是用kit抽的
: 還有plasmid的量跟copy number應該有關吧
我算了一下我抽的大概只有0.02ug/ul
這樣應該超少的吧...orz
那copy number該怎麼查相關資訊
: : 麻煩板上的各位 提供可能的原因
: : 或者有哪些資料可以參考的
: : 讓我可以試著排除問題
: : 不然實驗一整個沒辦法繼續下去
: : 先謝謝各位了
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◆ From: 163.15.177.142
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