Re: [求救] 抽DNA跟跑電泳的問題

看板Biotech (生命科學)作者 (過於喧囂的孤獨)時間17年前 (2008/09/11 19:36), 編輯推噓3(306)
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※ 引述《yaliu (雅)》之銘言: : ※ 引述《hsin1106 (過於喧囂的孤獨)》之銘言: : : 最近剛進實驗室開始做實驗 : : 在抽DNA跑agarose gel時碰到了幾個問題 : : 1.我的gel照UV的時候 頂端會整個偏白色 : : 比較上面的band會被蓋過去 不容易判讀 : 會不會buffer太髒,或者gel配太久了?? gel都是 現做的 1% buffer的話是公用的 : 如果片段太大可以降低agarose %數 : : 2.用BamH和NdeI切我的plasmid時 : : 我的比例是 兩種酵素 各加1μl : : DNA 7μl 跟 1μl 10X 的buffer : : DNA量比較多的話就等比例增加 : : 之後再37度下反應兩個小時 : : 可是跑完電泳 甚麼都看不到 : : (marker跟未切拿來當control的都有band) : 各loading的量? : 未切的和已切的各loading多少? 通常我都會loading一樣的量 loading過10μl跟20μl兩個量 : : 3.我的plasmid 是pET-15b : : 通常在菌液OD=1.5上下時用VIOGENE的kit抽 : : 抽出來的DNA稀釋10倍測260nm大概都在0.03~0.05之間 : : 這樣的量是不是偏少?? 是的話 有哪些可能會影響?? : 濃度應該用核酸測定儀測吧 : 不然可以對照marker的量 : 記憶上以前測過1mL的菌液萃取,好像頂多0.6~0.9 ug/ul吧 : 好像很難超過 1ug/ul (不曉得有沒有記錯.....) : 我是用kit抽的 : 還有plasmid的量跟copy number應該有關吧 我算了一下我抽的大概只有0.02ug/ul 這樣應該超少的吧...orz 那copy number該怎麼查相關資訊 : : 麻煩板上的各位 提供可能的原因 : : 或者有哪些資料可以參考的 : : 讓我可以試著排除問題 : : 不然實驗一整個沒辦法繼續下去 : : 先謝謝各位了 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 163.15.177.142

09/11 20:47, , 1F
pBR322 ori,中間偏低,約10~20copy number
09/11 20:47, 1F

09/11 23:15, , 2F
基本上切過的可以全load啦~不過你template其實加的蠻多的耶
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09/11 23:16, , 3F
問一下,你沒切過的跑電泳亮嗎?
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09/11 23:17, , 4F
如果本身plasmid濃度低的話,做酵素切割template在提高
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09/11 23:22, , 5F
另外,如果你有發現你的plasmid有越抽越少的趨勢,檢查一下
09/11 23:22, 5F

09/11 23:23, , 6F
你的抗生素還在不在...
09/11 23:23, 6F

09/12 10:59, , 7F
沒切過的跑電泳會亮...@@
09/12 10:59, 7F

09/13 23:47, , 8F
膠最好不要現做現用喔 最好事先放進烘箱 因為膠太熱
09/13 23:47, 8F

09/13 23:48, , 9F
會導致EtBr的降解喔(老闆說的)
09/13 23:48, 9F
文章代碼(AID): #18oGAXN1 (Biotech)
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