[求救] western的internal control 調不勻

看板Biotech (生命科學)作者 (被風吹跑了~)時間16年前 (2009/11/10 10:24), 編輯推噓2(203)
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大家好我是做western blotting的新手 最近實驗遇到瓶頸.想請大家幫忙 最近我在做KB跟L30 protein的表現 可是發現每次壓出來的internal control都不均勻 (我有分fraction, cytoplasm是壓b-tubulin. nucleus是壓lamin B) 我猜想幾個可能造成的原因 1.收細胞時,medium去除不乾淨 影響定量的結果 2.收細胞時 兩個細胞收的量不太一樣 影響定量結果 3.因為我把sample跟sample buffer加在一起之後去加熱.在loading到SDS-PAGE 時發現體積會比原本兩者混在一起的體積還少.我覺得自己使用pipette的技術 沒有問題.我在想會不會是這個環節有問題 因為只是猜測 不確定是哪邊出了問題 不過因為問題沒有解決 我有點害怕進行下一個實驗 所以想請大家幫我看看 這邊附上我收細胞到loading sample的流程 請大家幫我指正 1。用trypsin打下細胞。離心12000rpm 去除medium再用PBS wash一次 2。離心 去除PBS 3.用0.4M LYSIS buffer I與cell pellet mix 4。on ice 15 min 5.加入10%np40 votex後離心13000rpm 取上清液即為cytoplasmic extract 6.加入lysis buffer II與cell pellet mix 7。15分鐘內 約每1分鐘vortex 10秒 8。離心13000rpm 取上清液即為nucleus extract 9.將取得的sample做定量 10。定量的結果假設為2.41μg/μl,我每個well想loading 40μg.就加 16。5μl的sample與4μl 6x的sample buffer混勻(無論多少sample       都加4μl的sample buffer)  11.100度煮protein 10分鐘 12。loading sample 有錯麻煩大家指正 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 211.76.175.139

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收細胞我都用刮的 RIPA加下去後就刮刮刮 然後12000g離心
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我是整管sample加buffer全部調成一樣濃度 跑膠load一樣體積
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你取小體積配置的風險是 有一點點沾黏或誤差就會影響很大
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所以如果是直接加想要的蛋白質量而不是全部調成一樣
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誤差會比較大的意思嗎?
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文章代碼(AID): #1A-Cxdbv (Biotech)
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