Re: [求救] 請問ligation後出現突變的問題

看板Biotech (生命科學)作者 (啄木鳥)時間17年前 (2009/05/16 15:20), 編輯推噓3(303)
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※ 引述《SugarSa (Mr.)》之銘言: : 我的實驗是用從template當中P出我要的片段再接到vector中 : 但是好不容易接進去之後,挑colony、送定序卻發現insert錯了兩個點 : 由於之前有用同一個template P出序列正確的片段 : 所以可以排除是template問題 : 現在我的問題是 : 現在如果從同一個plate中,再挑新的colony,會有機會挑到對的嗎? : 還是一定要重新P,ligation,整個重來呢? : 謝謝 問題主要是在PCR, 你可能需要用好一點的taq. 或者, 在PCR mix中, 再外加 Mg2+, 也可以提高PCR 的正確率. 當然, 降低 cycle 數也是可以考慮的. 至於同一個plate是否可以再挑, 當然可以. 雖然有可能挑到正確的, 只是機會較小. -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.125.66

05/16 18:10, , 1F
因為我用的是phusion,理論上錯誤率應該很低才是
05/16 18:10, 1F

05/16 18:11, , 2F
然後我跑30個cycle,不知道為啥會錯了兩個點
05/16 18:11, 2F

05/16 19:34, , 3F
phusion就不是taq了,基本上應該有prove reading,你應該有
05/16 19:34, 3F

05/16 19:35, , 4F
照說明書設定PCR條件吧~~ 也許在重做一次應該就成功了吧
05/16 19:35, 4F

05/16 19:35, , 5F
錯誤機率應該沒那麼高
05/16 19:35, 5F

05/18 01:06, , 6F
你有排除定序錯誤了嗎?不然就多送幾個colony嚕
05/18 01:06, 6F
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