Re: [求救] 西方墨點測試蛋白的合成

看板Biotech (生命科學)作者 (專注)時間16年前 (2009/07/03 01:50), 編輯推噓1(101)
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原文恕刪

06/30 16:44,
會轉錄和轉譯後修飾是兩回事吧? 假設說這是個醣蛋白
06/30 16:44

06/30 16:44,
你用E.coli表現他的folding就不對了 之後真菌表現的
06/30 16:44

06/30 16:45,
有醣基化的話 可能就把你原本會辨識的epitope蓋住了
06/30 16:45

06/30 16:49,
拿你的胺基酸序列去預測一下epitope和轉譯後修飾位置
06/30 16:49

07/01 00:24,
..恩~了解 那再問一下..要預測 可以去哪測?(網站)
07/01 00:24

07/01 00:24,
還是說 我手上有DNA Star這套軟體 他可以作這預測嗎?謝謝
07/01 00:24
我想有點長還是回一下 DNA Star這套軟體裡的Protein可以預測 另外有些線上網站也可以預測epitope 1.Prediction Antigenic Peptides (Web): Harvard CVC Bioinformatics Tools – Predicting Antigenic Peptides http://bio.dfci.harvard.edu/Tools/antigenic.pl IEDB Analysis Resource http://tools.immuneepitope.org/tools/bcell/iedb_input 選擇Kolaskar & Tongaonkar Antigenicity (1990)或Bepipred Linear Epitope Prediction (2006) 方法。 2.Signal Peptides (Web): http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ 3.Phosphorylation sites (Web): http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/ 4.N-Glycosylation sites (Web): http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/ 5.O-Glycosylation sites (Web): http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/ 6.protein blast (Web): http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 這是要看你的抗原和免疫動物的親緣相似性 太相近免疫效果不好 -- 以上是修 單株抗體 課程的一些資料 有錯請更正 謝謝 -- 他 打 ㄋㄐ ∥你 被 卡卡獸 ∥幹 開 我 柏油 ∥我 打 瓦哥 每 我 ∥看 打 〒 〒 ∥你 心 的 ◢█ ∥的 腫◥◥◥ 天 。 ∥我 斷 ▼▼ ▼ ∥媽 就 瓦 ∥尾 。≧ ≦ ── ∥牙 了 ▲ ▲ ) ∥的 點 斯 ─⊙-⊙- ∥巴 ∥齒 。 / ∥他 火 ! ∥都 ∥都 ││ ∥不 燒 ∥被 腫 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 61.224.24.90

07/03 04:23, , 1F
推 整理很詳細 至於預測signal peptide的 還有很多種
07/03 04:23, 1F

07/03 04:24, , 2F
等哪天有空再來幫補上
07/03 04:24, 2F
文章代碼(AID): #1AJFDH22 (Biotech)
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