[求救] CHIP最後一步PCR的訊號時有時無

看板Biotech (生命科學)作者 (man)時間16年前 (2010/01/09 00:00), 編輯推噓3(302)
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最近正在進行CHIP實驗 系統已經set up差不多了 能從開始到最後一步PCR能看到有訊號 並且與預估結果相同 所以目前認定應該整個架構是OK的了 但是卻出現非常奇怪的問題 最後萃取出來的DNA拿去PCR之後跑膠 有時實驗結果非常的好 該有的BAND都有P出來 但是在把同一批DNA重新PCR 在拿去跑膠 卻什麼都沒P出來 連本來最明顯的input都是空白一片 本來認為是PCR機器的問題 但是後來拿去別台P也是一樣情況 不知道是不是其他的buffer或者是taq不穩嘛? 實驗室的CHIP protocol大致如下 1.福馬林固定 2.SDS lysis 3.sonication 4.IP O/N 5.Wash 6.65度C elution 7.45度C protease K 8.DNA purify 用 kit column 9.PCR 希望有CHIP高手指教 因為常常P不出來 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.128.67.245

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wash完應該是protease K 後 decrosslink 吧~
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01/11 01:18, , 2F
你可以先用input試PCR的條件 確定有很亮的band
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CHIP產物PCR不穩定 我以為這是很正常的現象 XD
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01/11 06:21, , 4F
要看你抓什麼東西 之前我做學長的sample 抓TopoII的
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01/11 06:22, , 5F
結果令我想在我臉上寫個慘字
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文章代碼(AID): #1BHrQVmJ (Biotech)
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