[求救] pichia pastoris X-33 transformation

看板Biotech (生命科學)作者 (火球連發~)時間16年前 (2010/03/03 13:00), 編輯推噓2(2022)
留言24則, 4人參與, 最新討論串1/2 (看更多)
請問各位 我目前在做pPICZaC分別插入三段片段 轉殖到P. pastoris X-33 先使用PmeI去切線性質體(需要clean up嗎?) 升任細胞製作是培養3ml YPD overnight 30度 250rpm 在隔天取100ul接種到100ml YPD約八小時長到OD600 1.3~1.5 (時間會不會太短?) 6000rpm離心去培養基 冰無菌水100ml重新懸浮5000 rpm離心 在使用50ml無菌水+4ml 1M sorbitol懸浮 5000rpm離心 在使用20ml 1M sorbitol懸浮 5000rpm離心 最後用200ul 1M sorbitol回溶得到勝任細胞 再把切好的質體10ul+80ul勝任細胞混勻 冰上5分鐘 1500V 15uF 335電阻 電擊 加入1ml 1M sorbitol放30度1.5小時 塗YPDS plate 100ug/ml Zeocin 養兩天挑菌 抽genomic DNA 用5'AOX1 3'AOX1 primer PCR 95度4 min 1cycle; 94 60sec, 55 60sec, 72 150sec 34cycle; 72 10min 1 cycle 結果都只有P到菌體本身的AOX1 gene沒有轉入的基因 請問哪裡有問題 有研究的大大 幫忙指證一下 謝謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.35.106 ※ 編輯: relaxsleep 來自: 140.129.35.106 (03/03 13:01)

03/03 15:19, , 1F
建議以更高濃度的Zeocin進行篩菌~並將同一菌落點在不同
03/03 15:19, 1F

03/03 15:20, , 2F
抗性的Zeocin上~選擇高抗性又長得大顆的菌株~以少量
03/03 15:20, 2F

03/03 15:21, , 3F
誘導的方式判斷哪一個菌株會產生你要的蛋白質~
03/03 15:21, 3F

03/03 15:23, , 4F
基本上以PCR方式確定~也行~但我之前也有發生P不到的事~
03/03 15:23, 4F

03/03 16:51, , 5F
濃度是依照invitrogen protocal建議用100的
03/03 16:51, 5F

03/03 16:53, , 6F
p不到不就代表沒送進去喔? 誘導的話後續步驟感覺蠻繁
03/03 16:53, 6F

03/03 16:53, , 7F
雜的 不知道有沒有快速篩選的方法 不然沒送進去誘導也
03/03 16:53, 7F

03/03 16:54, , 8F
是白做的感覺@@"
03/03 16:54, 8F

03/03 19:27, , 9F
對~但是你可以增高抗生素濃度做進一步的篩選~提高選中
03/03 19:27, 9F

03/03 19:27, , 10F
機率
03/03 19:27, 10F

03/03 19:28, , 11F
但我曾經有做過P不到但誘導得出來的事~而且誘導得出來
03/03 19:28, 11F

03/03 19:28, , 12F
才是重點阿!
03/03 19:28, 12F

03/03 19:30, , 13F
不然你可以篩選高抗性的菌株再進一步去PCRㄝ行~
03/03 19:30, 13F

03/03 19:40, , 14F
還是先誘導看看吧 有時候不一定P得出來 但是可以表現蛋白質
03/03 19:40, 14F

03/03 19:43, , 15F
培養幾mL就夠了 如果擔心看不到的話 先做蛋白質沉澱再跑膠
03/03 19:43, 15F

03/03 21:04, , 16F
恩 謝謝 我有試過2000的 幾乎都會長 但是還是p不到@@
03/03 21:04, 16F

03/05 15:36, , 17F
切完的質體要 clean up 我們都是先挑 300隻
03/05 15:36, 17F

03/05 15:36, , 18F
然後再挑到5X抗性的plate 之後你可以選擇用試管小量
03/05 15:36, 18F

03/05 15:37, , 19F
誘導然後跑PAGE 或者用 96孔盤養菌然後用ELISA篩菌
03/05 15:37, 19F

03/05 15:38, , 20F
如果都做不出來可以分析一下 codon usage 最近發現很
03/05 15:38, 20F

03/05 15:38, , 21F
多表現量很差都是跟 codon usage 有關 = =
03/05 15:38, 21F

03/06 13:40, , 22F
可以請問96孔盤養菌然後用ELISA篩菌的方法嗎 我沒用過
03/06 13:40, 22F

03/06 13:40, , 23F
這方法@@
03/06 13:40, 23F

03/10 21:09, , 24F
我們家很少在抽 genome 除非你要做 copy number 啦
03/10 21:09, 24F
文章代碼(AID): #1BZUppaf (Biotech)
文章代碼(AID): #1BZUppaf (Biotech)