Re: [求救] 釣出全長序列,未知基因

看板Biotech (生命科學)作者 ( .__________.)時間12年前 (2013/06/05 11:31), 編輯推噓0(000)
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※ 引述《EDONIS (ED)》之銘言: : 請問由於用cDNA library的方法 CLONE到一段序列 : 是片段序列,老師希望我能把這序列的全長拿到!! : 在去比對看是甚麼。請問這能RACE的方法來做嗎?? : 還是?? 假設你找到的東西在Genebank上面沒有 那你可以... 1. 丟BLAST找最接近的基因(總不可能是你排骨開天第一人吧) 2. 用找到的已知基因去做BLAST後 取最接近的前十個hit做multiple alignment 3. 找到conserved region(總不能可能你是排骨開天第一人吧) 4. 從 conserved region設計primer 如果conserved region不夠長就設計 degenerate primer primer的3' 最好是放在conserved region上面 5. PCR, TA cloning, sequencing 6. RACE有點麻煩 其實不用這麼麻煩的 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 211.76.175.170
文章代碼(AID): #1Hhh4LUR (Biotech)
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