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[求救] 一個普生範圍的PCR問題

看板Biotech (生命科學)作者時間11年前 (2013/06/27 21:04), 編輯推噓6(6推 0噓 48→)
留言54則, 11人參與, 最新討論串1/1
"如果一個蛋白質有100個胺基酸， 假設在其對應的基因上頭尾各設計一條引子， 以PCR增幅，請問產物大小有哪幾種可能？" 這是嘉義大學去年的大一轉學生考題， 看了很多次還是不明白問題在問什麼。 想說也許對常做實驗的板友會是挺基本的問題， 希望大家看看幫忙， 感恩!!! --- 初次發問，請多包涵>< -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 123.0.194.113
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06/27 21:12, , 1F
應該可以簡化成:一個100a.a.的蛋白質其基因長度有幾種可能?
06/27 21:12, 1F
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06/27 21:13, , 2F
考慮intron splicing的話感覺有無限多種耶...@@
06/27 21:13, 2F
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06/27 21:14, , 3F
題目給的條件太少...
06/27 21:14, 3F
推
06/27 21:35, , 4F
這種題目應該是在沒有alternative splicing的前提下吧= =
06/27 21:35, 4F
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06/27 22:19, , 5F
如果是這樣我看到的都是問長度不是問幾種耶
06/27 22:19, 5F
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06/27 22:24, , 6F
那請問產物長度是？
06/27 22:24, 6F
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06/27 22:26, , 7F
"600 nucleic acids的DNA*2^PCR次數"嗎？
06/27 22:26, 7F
推
06/27 23:06, , 8F
無限多種吧 xDD
06/27 23:06, 8F
推
06/27 23:49, , 9F
那應該回PCR product 大於等於 300 bp
06/27 23:49, 9F
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06/27 23:57, , 10F
這題應該是申論題吧......
06/27 23:57, 10F
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06/27 23:58, , 11F
1. 有沒有intron 2. 蛋白質100aa有無包含被切掉的Signal
06/27 23:58, 11F
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06/27 23:59, , 12F
peptide? 3. PCR的目的是什麼？
06/27 23:59, 12F
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06/28 00:00, , 13F
然後我覺得應該是≧303，因為要加上stop codon
06/28 00:00, 13F
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06/28 00:19, , 14F
2.一般講完整的蛋白質產物會包含signal peptide嗎？
06/28 00:19, 14F
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06/28 00:21, , 15F
還有，100aa有無包含stop codon對應的aa...
06/28 00:21, 15F
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06/28 00:23, , 16F
stop codon不會產生aa，所以100aa的DNA序列絕對不包含
06/28 00:23, 16F
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06/28 00:25, , 17F
說完整蛋白質會不會包含signal peptide我就不清楚了...
06/28 00:25, 17F
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06/28 02:23, , 18F
所以才說沒splicing最簡單就是303bp，有的話就無限種囉
06/28 02:23, 18F
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06/28 02:24, , 19F
請問"600 nucleic acids的DNA*2^PCR次數"是什麼意思?
06/28 02:24, 19F
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06/28 03:24, , 20F
講錯了>< 是start codon對應的Met
06/28 03:24, 20F
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06/28 03:26, , 21F
回上方 "兩條DNA有600個核苷酸乘以二的PCR次數為次方"
06/28 03:26, 21F
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06/28 03:28, , 22F
但計算核苷酸的量應該不對，用bp來回答"產物大小"很好
06/28 03:28, 22F
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06/28 03:30, , 23F
啊，PCR不用start codon只需要stop codon對吧!
06/28 03:30, 23F
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06/28 03:34, , 24F
在這整理一下答案喔 "若考慮原本基因之間的intron以及
06/28 03:34, 24F
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06/28 03:35, , 25F
alternative splicing，PCR產物大小將有無限多種；而若
06/28 03:35, 25F
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06/28 03:37, , 26F
不考慮intron及alternative splicing(即只考慮coding
06/28 03:37, 26F
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06/28 03:39, , 27F
sequence)，PCR產物大小為100aa對應的300bp，加上做為
06/28 03:39, 27F
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06/28 03:41, , 28F
stop codon的3bp，PCR產物大小至少為303bp。"
06/28 03:41, 28F
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06/28 03:42, , 29F
感謝大家! 有錯還請指教:)
06/28 03:42, 29F
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06/28 08:53, , 30F
嗯..題目說primer設在"頭尾", 如果要辯的話也能說稍往裡面
06/28 08:53, 30F
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06/28 08:53, , 31F
設的話就會比303bp短了, 所以這題真的很不清楚
06/28 08:53, 31F
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06/28 08:54, , 32F
不過大致同意原po推文整理的答案!
06/28 08:54, 32F
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06/28 08:56, , 33F
還有PCR其實start/stop codon都不用考慮 那是轉譯時才用得
06/28 08:56, 33F
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06/28 08:58, , 34F
到, 故在原基因上補回stop codon的3bp
06/28 08:58, 34F
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06/28 08:59, , 35F
PCR就是忠實地把template上的ATCG序列複製放大而已
06/28 08:59, 35F
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06/28 09:05, , 36F
剛想到忘記考慮到5'和3'-UTR...這樣更複雜了@@
06/28 09:05, 36F
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06/28 10:51, , 37F
爛題目 如果有 alternative splicing怎麼辦
06/28 10:51, 37F
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06/28 10:52, , 38F
不過這種就是很典型的國考題目 想要正確回答就要知道題目的
06/28 10:52, 38F
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06/28 10:53, , 39F
完整條件 然後這個完整條件你要去上某個老師的課才會知道
06/28 10:53, 39F
推
06/28 14:28, , 40F
BestANS: 我們都用DNAstar .. 啥? Primer3??
06/28 14:28, 40F
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06/28 17:51, , 41F
3種
06/28 17:51, 41F
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06/28 22:39, , 42F
我忽然想到它該不會要問的是 PCR 過程中的產物種類吧...
06/28 22:39, 42F
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06/28 22:40, , 43F
這樣就會是 oCD 說的三種：temp+Forwardprimer
06/28 22:40, 43F
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06/28 22:41, , 44F
temp+Reverseprimer 還有 forwardprimer+reverseprimer
06/28 22:41, 44F
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06/28 22:41, , 45F
夾出來的產物......跟蛋白質多大一點關係都沒有 =_=
06/28 22:41, 45F
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06/29 06:04, , 46F
這樣就不用給100a.a.的資訊了, 且有特別問產物"大小"
06/29 06:04, 46F
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06/29 06:07, , 47F
這樣講的話不如說過程中每elongation1個bp就算1種->??
06/29 06:07, 47F
推
06/29 23:19, , 48F
還真的是3種 不過知道這個沒多大意義就是....
06/29 23:19, 48F
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06/29 23:20, , 49F
夾來夾去 還是只要那一種
06/29 23:20, 49F
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06/30 12:10, , 50F
同意...這題比較像整人題 答案太偏頗根本無法說服人
06/30 12:10, 50F
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06/30 16:09, , 51F
唉...這種考題竟然出現在大學轉學考，國家前途何在？
06/30 16:09, 51F
推
06/30 16:19, , 52F
不過這個問題會出現在template過多而造成smear的原因
06/30 16:19, 52F
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06/30 16:20, , 53F
不能說全然無用 但題目這樣簡述只會誤導人而已
06/30 16:20, 53F
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06/30 16:21, , 54F
很像是個無用的冷知識 要用在哪搞不好也不知道= =
06/30 16:21, 54F
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