[求救] 新手想仔細請教電穿孔法步驟

看板Biotech (生命科學)作者 (a72830044)時間12年前 (2013/09/04 01:33), 編輯推噓0(004)
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小弟目前正要開始嘗試用電穿孔法 overcross兩段基因 大致上的流程是懂了,但是一些細部的部分不是很了解 從一開始拿出-70度C的菌液就不太懂 1.拿出菌液後置於冰上,待其微溶時取 5ul加至 5ml培養液中震盪隔夜培養 2.隔日從過夜菌液中取 50ul加入 10ml培養液中震盪培養 2hr開始每20分鐘測一次OD 3.待OD=0.5時冰浴10分鐘,在4度C下以4000rpm離心10分鐘 4.倒掉上清液並以 10ml滅菌水輕輕的沖混,然後再同條件離心10分鐘 5.倒掉上清液並以 5ml滅菌水輕輕沖混,以同條件離心10分鐘 6.最後加入 1ml含10%甘油的冰冷溶液沖混,後以 100ul分裝保存於 -70度C 第一個疑問,步驟1 這樣是可以的嗎?還是要先做一些處理? 第二個疑問,步驟5 當中所提到個甘油溶液是甘油+滅菌水? 第三個疑問,如果我今天要進行電穿孔法了,那含甘油的勝任細胞是直接可以使用? 第四個疑問,我在其他crossover的文獻上有看到設計另外一段篩選的基因 如果是電穿孔完、塗plate然後直接送定序檢查這樣需要設計那段基因嗎? 最後一個問題...小弟的質體總長度大概 8K bp左右 用一般的熱休克法可能成功做出crossover嗎?在質體上共有前後各 50bp的同源序列 而同源序列夾住的基因長度約 1.6K bp,欲取代位置的基因長度也約 1.6K bp 如果有缺條件的我會再補述 感謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 118.163.252.247

09/04 06:24, , 1F
你要做E.coli的電穿孔嗎? 如果是的話 1 2 3 的答案都是yes
09/04 06:24, 1F

09/04 06:25, , 2F
第四個問題如果要送的基因沒有selection marker 那要怎麼篩?
09/04 06:25, 2F

09/04 06:28, , 3F
這樣會挑不到單一菌落送定序 有沒有考慮換小一點的載體
09/04 06:28, 3F
是要做 Pseudomonas putida的電穿孔 嗯...第四個問題我基因丟進去之後會製造PCA,我是打算配plate,加入會使PCA顯色的藥品 進而挑選有使周圍變色的菌落 ※ 編輯: a72830044 來自: 140.123.126.147 (09/04 11:20)

09/04 21:07, , 4F
電完之後記得做不同體積的塗盤 有可能菌落會長的太密不易挑
09/04 21:07, 4F
感謝,我大致上瞭解了! ※ 編輯: a72830044 來自: 140.123.126.147 (09/05 00:01)
文章代碼(AID): #1I9XrOUN (Biotech)
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