PTT職涯區 / Biotech (生命科學)

[討論] 推薦的RNA seq廠商

看板Biotech (生命科學)作者 (MichaelHsien)時間9年前 (2016/07/11 10:07), 9年前編輯推噓17(17推 0噓 23→)
留言40則, 12人參與, 最新討論串1/2 (看更多)
哈囉大家好 我的研究想要做RNA seq 詢問了幾家廠商，發現有不少人在做 像是 基龍米克斯、源資、圖爾斯…等等（非廣告） 但是不知道這幾家廠商定序品質及事後分析服務是否完善 (我們不是很擅長生物資訊方面，所以希望事後分析要夠好...) 請問板上的各位 是否有推薦的廠商 或是很雷的廠商…QQ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 101.10.22.63 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1468202849.A.4CD.html
推
07/11 13:18, , 1F
都很雷啊... 簡單作法 叫每間都報 討論你要怎麼作
07/11 13:18, 1F
→
07/11 13:19, , 2F
如果你們lab本身找不到生資分析人員 我建議先找別的lab合
07/11 13:19, 2F
→
07/11 13:19, , 3F
作 然後再請他們推薦要找哪間跑RNA seq
07/11 13:19, 3F
推
07/11 16:05, , 4F
淚推樓上!
07/11 16:05, 4F
推
07/11 17:23, , 5F
很多都是外包，收件後送到北京華大定序分析
07/11 17:23, 5F
其實我比較在意定序後的分析... 不知道jabari和silverberry有什麼辛酸血淚史嗎...? ※ 編輯: michaelhsien (61.230.145.1), 07/11/2016 20:39:28
推
07/11 21:03, , 6F
值拿回來 丟IPA
07/11 21:03, 6F
推
07/11 21:14, , 7F
廠商的好處是報告弄的漂漂亮亮的 很好理解，但沒法跟你
07/11 21:14, 7F
→
07/11 21:14, , 8F
分析到最後， 學術合作可以跟你磨到後面，但報告的UI做
07/11 21:14, 8F
→
07/11 21:14, , 9F
不好
07/11 21:14, 9F
推
07/11 21:17, , 10F
台灣的廠商都外送到大陸了～根本沒有在台灣做啊
07/11 21:17, 10F
→
07/11 21:18, , 11F
面對中國的產品與服務，我們就要面對他囉～(老闆說的)datab
07/11 21:18, 11F
→
07/11 21:18, , 12F
ase 真的很龐大
07/11 21:18, 12F
推
07/11 22:07, , 13F
看實驗目的吧..廠商能出圖表但不見得是你們想要的東西啊
07/11 22:07, 13F
推
07/11 22:22, , 14F
不會做生資別花錢做RNASeq, 廠商的分析也不要太信
07/11 22:22, 14F
推
07/11 22:27, , 15F
其實我想說RNAseq退流行了 現在有protein scan的...
07/11 22:27, 15F
→
07/11 23:00, , 16F
應該先問,你想得到怎樣的data,以及只有RNAseq能解決問題?
07/11 23:00, 16F
→
07/11 23:03, , 17F
現在已經有許多OA data,廠商能給的也不脫離這些內容,如果
07/11 23:03, 17F
→
07/11 23:06, , 18F
你真的想送樣,至少先知道後續會遇到的困難
07/11 23:06, 18F
推
07/11 23:37, , 19F
先決定你要用的平台跟分析的方向或者有paper可以當範本
07/11 23:37, 19F
→
07/11 23:38, , 20F
舉例，再看看你預算的上限是多少，拿著這些去跟廠商討
07/11 23:38, 20F
→
07/11 23:38, , 21F
論。如果完全沒經驗的話建議跟樓上先進說的一樣找人合作
07/11 23:38, 21F
→
07/11 23:38, , 22F
，data產出後面的工作還很多，很難錢丟了就解決，
07/11 23:38, 22F
推
07/11 23:48, , 23F
講具體一點就是可以先想想你的論文或報告裡希望能畫出
07/11 23:48, 23F
→
07/11 23:48, , 24F
怎樣的圖跟比較表，把這些需求同時跟廠商討論這樣會比
07/11 23:48, 24F
→
07/11 23:48, , 25F
較清楚。
07/11 23:48, 25F
推
07/11 23:52, , 26F
然後在台灣自己有機器自己跑的也還不少家，被對岸價格
07/11 23:52, 26F
→
07/11 23:52, , 27F
壓著打就是了。
07/11 23:52, 27F
推
07/11 23:58, , 28F
要不要先做QPCR array看看mRNA表現量差異
07/11 23:58, 28F
推
07/12 00:02, , 29F
先問清楚 這個計畫一定得跑RNAseq嗎? 還是他已經寫死 你一
07/12 00:02, 29F
→
07/12 00:03, , 30F
定得上... 或者是你們有候選基因了 只是跑一下到時候其中
07/12 00:03, 30F
→
07/12 00:03, , 31F
報告好過關 因為這個坑很大啊...沒有生資背景的拿到會被騙
07/12 00:03, 31F
→
07/12 00:03, , 32F
很大
07/12 00:03, 32F
推
07/12 00:44, , 33F
建議你跟你老闆先看這:http://tinyurl.com/jrqky4z
07/12 00:44, 33F
→
07/12 00:46, , 34F
你跟老闆從第28張開始看,看不懂的話做RNASeq很容易被騙
07/12 00:46, 34F
→
07/12 00:48, , 35F
至於protein scan目前還只是炫而已...而且用途不同
07/12 00:48, 35F
推
07/12 00:54, , 36F
雖然能夠很直接量蛋白量,但能量到的蛋白還是有限,準度也..
07/12 00:54, 36F
推
07/12 03:31, , 37F
我認識一位受害者...欸 老闆你來啦??
07/12 03:31, 37F
→
07/12 17:12, , 38F
廠商都很雷，給的東西完全不能用
07/12 17:12, 38F
→
07/12 17:13, , 39F
我們後來都自行分析了，如果沒有分析能力
07/12 17:13, 39F
→
07/12 17:13, , 40F
建議不要做，浪費錢而已
07/12 17:13, 40F
‣ 更多 michaelhsien 的文章
文章代碼(AID): #1NWlzXJD (Biotech)
討論串 (同標題文章)
以下文章回應了本文：
完整討論串 (本文為第 1 之 2 篇)：
排序： 最新先 | 最舊先 | 留言數
在新視窗開啟完整討論串 (共2篇)
Biotech 近期熱門文章
更多 近期熱門文章 >>
PTT職涯區 即時熱門文章
更多 即時熱門文章 >>
‣ 更多 michaelhsien 的文章
文章代碼(AID): #1NWlzXJD (Biotech)