[求救] phenol-chloroform的貯存時間...

看板Biotech (生命科學)作者 (phoebe)時間8年前 (2017/07/23 22:53), 8年前編輯推噓5(506)
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我因為某些原因需用傳統法純化ligation完的DNA 再買新的試劑前發現實驗室有放很久很久(可能超過五年吧= =) 的phenol-chloroform isoamyl alchohol (25:24:1) 一直冰在四度c,棕色瓶,顏色還是純淨透明的 (有可能還沒開過) 聽說這個試劑的萃取效率會逐漸變差 我看大部分的有效日期頂多到一年 想請問這樣還可以用嗎= =? 今天有拿plasmid試著抽,方法大致如下 (有可以加強的麻煩指點>"<) 100 ul DNA與試劑等體積混合均勻後 13000 rpm, RT離5分鐘後取水層 (沒有repeat) 直接進酒精沉澱 先加0.5倍體積的 7.5M ammonium acetate然後加2.5倍體積的100%酒精 -80三小時 然後15000 rpm, 4度c 30分鐘 之後用預冷的70%酒精wash兩次 (只有第一次有看到pellet) air dry,用PCR grade water回溶 測得濃度只有原先的0.4倍,260/280只有1.5多... 我之後純化完的DNA要用做ivt的template 之前都用column純化,但好像量會比較少,也沒法去除endogenous RNase 所以就被建議用傳統法抽,但目前實驗室沒人有經驗 所以想請問版上大大相關的問題,以及操作上要注意的地方 還請不吝回答orz謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 101.0.152.172 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1500821609.A.296.html ※ 編輯: kaofei (101.0.152.172), 07/23/2017 22:53:47 ※ 編輯: kaofei (101.0.152.172), 07/23/2017 22:54:19

07/24 01:05, , 1F
沒印象要加 ammonium acetate耶
07/24 01:05, 1F

07/24 01:08, , 2F
要加阿 我學的protocol是加1/10體積的5M amonium acet
07/24 01:08, 2F

07/24 01:08, , 3F
ate 不過多加好像也沒差
07/24 01:08, 3F

07/24 01:08, , 4F
wash離久一點唄
07/24 01:08, 4F

07/24 01:15, , 5F
我直接加純酒精-20度,1h就離心了
07/24 01:15, 5F

07/24 08:49, , 6F
也有人加3M sodium acetate但我不曉得跟Ammino有甚麼差
07/24 08:49, 6F

07/24 08:50, , 7F
所以,PCI放這麼酒還是可以用的嗎?是否沒變紅就是沒氧化
07/24 08:50, 7F

07/24 13:07, , 8F
試過 Na acetate; 用途跟 ammonium acetate應該都是增
07/24 13:07, 8F

07/24 13:07, , 9F
加離子濃度,讓 dna更易被EtOH沉澱下來
07/24 13:07, 9F

07/24 13:20, , 10F
我家的 PCI是放了快3年囧 但還能抽的出來
07/24 13:20, 10F

07/24 16:52, , 11F
不夠純的話PC可以萃兩次囉
07/24 16:52, 11F
文章代碼(AID): #1PTBXfAM (Biotech)
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