[求救] 請問flux balance analysis原理
大家好，我在某篇文章看到flux balance analysis的實驗方法
比較某個gene 沒有knock out與knock out時，經過cecal ligation puncture
後48小時，先測量glycolysis和gluconeogenesis裡面的metabolites(這些
metabolites用GC/MS和UPLC決定)，
測量出來的metabolites量再輸入iMM1415這個老鼠的model
(這個model裡面有老鼠所有基因和反應，以及將
某個基因或反應delete後所影響到的生理代謝作用例如glycolysis)
然後用flux balance analysis看ATP generation的方法，
評估glycolysis與gluconeogenesis的反應是增加還是減少
我想請問一下，
1.metabolites的濃度測量通常是用質譜儀量測嗎？
2.為何要再將data整合進iMM1415這種老鼠的model
3.要如何利用ATP的產生多寡來判斷反應的增加或是減少？
謝謝!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 123.193.233.40
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1511084657.A.4F3.html
Biotech 近期熱門文章
PTT職涯區 即時熱門文章
