[問題] 關於blast的用法

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (evil)時間16年前 (2008/07/02 21:52), 編輯推噓2(202)
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我知道blast是用來做序列比對的 但是有人知道blast可以用來"去除"序列相似度高的序列嗎? 我目前知道cd-hit可以這樣做 如果知道的話,可以先告訴我這指命嗎? 謝謝大家 ps:看來最近一堆人忙著趕論文,沒時間發問了 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 118.169.52.233

07/03 11:06, , 2F
你的問題應該是要reduce redundancy 吧!試試看這個
07/03 11:06, 2F

07/03 11:07, , 3F
網址吧! Good luck!
07/03 11:07, 3F

07/03 11:43, , 4F
有啊..assembly的時候可以利用blast找到的序列做masking
07/03 11:43, 4F
文章代碼(AID): #18QuWmVX (BioMedInfo)
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