Re: [程式] 關於R-cluster的input file 所接受的格式

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (evil)時間15年前 (2009/05/05 15:07), 編輯推噓1(108)
留言9則, 4人參與, 最新討論串4/4 (看更多)
我已經會使用R-cluster,請問大家,如何讓結果輸出 以下是我輸入的指令, mydata <- read.table("test.matrix", header=T, sep="\t", row.names=1) mydata <- na.omit(mydata) mydata <- scale(mydata) d <- dist(mydata, method = "euclidean") myTree_avg <- hclust(d, method="average") plclust(myTree_avg, hang = 0.1, unit = FALSE, level = FALSE , square = TRUE, labels = NULL, plot. = TRUE, axes = TRUE, frame.plot = FALSE, ann = TRUE, main = "", sub = NULL, ylab = "dissimilarity") str(as.dendrogram(myTree_avg))<==只有在螢幕上秀出結果,但是我想要輸出在檔案 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.138.155.193

05/10 17:15, , 1F
png("mygraph.png")
05/10 17:15, 1F

05/10 17:16, , 2F
plot(myTree_avg)
05/10 17:16, 2F

05/10 17:16, , 3F
dev.off()
05/10 17:16, 3F

05/10 17:17, , 4F
我後來才發現,原來我早就做好了,只是我用ssh連到server
05/10 17:17, 4F

05/10 17:17, , 5F
但是我沒有安裝x11,所以我一直看不到圖,= =真麻煩
05/10 17:17, 5F

05/11 07:04, , 6F
從msg應該就可以看出來啦..XD
05/11 07:04, 6F

05/12 23:28, , 7F
rdesktop是你的最佳選擇 =,=
05/12 23:28, 7F

05/14 13:15, , 8F
R有windows版本,問題解決了,我當初那個是用ssh連到伺服
05/14 13:15, 8F

05/14 13:15, , 9F
當然無法做出圖來,現在可以了
05/14 13:15, 9F
文章代碼(AID): #19_-MWJj (BioMedInfo)
文章代碼(AID): #19_-MWJj (BioMedInfo)