Re: [問題] 生物化學
O Ca : alpha碳 打不出來...
|
Ca- C - N - Ca
↑ | ↑
psi H phi
peptide的基本架構如上,兩個aa之間由peptide bond形成,有個很重要的特性是peptide
bond是不可以旋轉的,但是alpha碳上面的兩個phi bond跟psi bond可以360度旋轉,因為
aa的特性不同所以使旋轉的角度也有所不同才能夠形成不一樣的secondary structure,
例如說在alpha helix的結構下,phi角度約-45~-50度,psi角度約為-60度,從這個課本
上的例子來看,這兩個角度並不會相同,其實也因為有這兩個角度的不同才讓分子有夠
自由的空間能夠形成更多種folding。
CD我印象中是測定二級結構最好最方便的一種方法,原理大概是類似把peptide丟進去,
利用分子旋光性的不同可以跑出一定的波長跟吸光度的圖譜,alpha helix、beta sheet及
random coil會有不一樣的圖譜,一眼就可以看出peptide是屬於哪種結構。
其中的random coil就是除了常見的helix、sheet以外的第三種沒有規律的結構,就是
peptide是隨意纏繞沒有規律的,應該就是你所要問的random conformation。所以你讀到
的資料可能是告訴你random coil這種二級結構在210-220nm的波長間會有最大的吸光值這
個特性。
※ 引述《zinga (zinga)》之銘言:
: 請問一下 secondary structure 的 phi角 和 psi角 都是相等的嗎??
: 還有Random conformation 和 Circular dichroism spectrum exhibits
: a maximum in the 210-220nm 有甚麼關係??
: Random conformation 又是甚麼??
: 懇請高手解答 thx!!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 218.175.177.68
推
11/15 04:26, , 1F
11/15 04:26, 1F
推
11/15 13:15, , 2F
11/15 13:15, 2F
※ 編輯: sunnysky7 來自: 218.175.177.68 (11/16 01:40)
討論串 (同標題文章)
Biology 近期熱門文章
PTT職涯區 即時熱門文章