Re: [問題] 請教關於SNP 之rs number
※ 引述《sonnet77 (蘇娜)》之銘言：
: 【問題】：想請問關於某個基因的SNP之rs number 要如何利用NCBI來尋找ㄋ
: 【問題起因】：一年前有使用過NCBI找過 但很久沒碰了有點忘記怎麼尋找想要再次
: 喚起記憶,也因為最近開始寫論文也需要.
: 【個人看法】： 記憶中好像是先要找到我們要的SNP 之兩段primer,再將這兩段primer
: 帶進去NCBI的某個系統,之後就不記得ㄌ阿 > <.救命..
: 感謝!!
不是很習慣使用NCBI來查已知的SNP
個人推薦兩種簡單的方法
(1) 使用中研院生醫所國家基因型鑑定中心所研發的網頁
http://genepipe.ngc.sinica.edu.tw/visualsnp/input.do
直接輸入你想查詢的gene name
即可查到該gene目前已知的rs number
還會貼心的提醒你該SNP的Risk Level
若想要查到更詳細的SNP 有advance option可點選
(2) 使用ensembl的網頁
http://www.ensembl.org/index.html
輸入gene name / 點選該gene / 點選transcript info/
選單下拉 點選"Show the following features"中的 SNPs即可
PS:沒回答到原PO的問題 但是希望有幫你解決到問題
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※ 編輯: chingheng 來自: 123.252.118.170 (01/29 22:18)
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