Re: [問題] 請教關於SNP 之rs number

看板Biology (生物學)作者 (蘇娜)時間18年前 (2008/02/01 14:19), 編輯推噓0(000)
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非常謝謝你~! ※ 引述《chingheng (loy)》之銘言: : ※ 引述《sonnet77 (蘇娜)》之銘言: : : 【問題】:想請問關於某個基因的SNP之rs number 要如何利用NCBI來尋找ㄋ : : 【問題起因】:一年前有使用過NCBI找過 但很久沒碰了有點忘記怎麼尋找想要再次 : : 喚起記憶,也因為最近開始寫論文也需要. : : 【個人看法】: 記憶中好像是先要找到我們要的SNP 之兩段primer,再將這兩段primer : : 帶進去NCBI的某個系統,之後就不記得ㄌ阿 > <.救命.. : : 感謝!! : 不是很習慣使用NCBI來查已知的SNP : 個人推薦兩種簡單的方法 : (1) 使用中研院生醫所國家基因型鑑定中心所研發的網頁 : http://genepipe.ngc.sinica.edu.tw/visualsnp/input.do : 直接輸入你想查詢的gene name : 即可查到該gene目前已知的rs number : 還會貼心的提醒你該SNP的Risk Level : 若想要查到更詳細的SNP 有advance option可點選 : (2) 使用ensembl的網頁 : http://www.ensembl.org/index.html : 輸入gene name / 點選該gene / 點選transcript info/ : 選單下拉 點選"Show the following features"中的 SNPs即可 : PS:沒回答到原PO的問題 但是希望有幫你解決到問題 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 210.241.43.118
文章代碼(AID): #17ehdxuy (Biology)
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