[求救]如何從PDB fromate資料中分析出蛋白質的DNA binding residue?
請教各位高手,這個問題已經困擾我很久了,可是我並非本科系,所以有一些推測出來
想法也不確定是否真的如我所想,看過PDB formate的說明書,可是裡面並沒有很明確的
解釋那些residue是與DNA binding有關,理論上他們判斷是否DNA binding是與此residue
與DNA的距離來決定的(不確定是否如此)。那要如何判斷某個residue與DNA的距離呢?
是否可以舉例說明?因為需要寫程式來判斷binding residue,
PDB的format相當的複雜,已經摸索一陣子還是不著頭緒,
懇請各位不吝指教!
可以寄信給我或者是加我的skype: tabascochang,感激不盡!
如果我PO錯地方麻煩告訴我,我會字D謝謝你。
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推
01/13 13:32, , 1F
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