Re: [問題]cell要染PI跑cytoflow可以用PFA固定嗎?
※ 引述《stonegirl.bbs@ptt.cc (Girls, be ambitious)》之銘言:
: 我的細胞會表現EGFP 因為我染PI(propidium iodide)想要看cell cycle
: 希望看得是有表現EGFP的細胞
: 我原本是照PI的protocol利用EtOH固定 結果跑flow時完全偵測不到EGFP
: 跟學長討論的結論是可能酒精會影響EGFP表現
: 想問問各位前輩們 我要做PI染色可以用paraformaldehyde固定嗎?
EGFP expression通常在細胞被固定之後
就看不到了
如果你的GFP在被PFA固定後 還可以被偵測到
那你倒可以試試
PI staining本身只要細胞被permeablize
PI可以進入細胞核染到DNA
我想如何固定細胞 應該不是最大的問題
我的建議是用EGFP antibody做intracellular staining
至於如何將PI staining和intracellular staining結合在一起
最常被使用的範例就是 anti-BrdU和PI的例子
我稍微google了protocol (可以看看他們如何固定細胞)
貼一個範例給你參考
http://www.cancer.wisc.edu/clinician/flow/protocol-brdpi.html
: 另外我想再問關於flow的問題
: 我們學校那台flow共有三個濾片 FL1 FL2 FL3
: 看EGFP是用FL1 我查了一下emission在508nm
: 看PI 用FL3 PI emission在620nm 但是PI + DNA 約在514nm
: 那這兩個會不會影響到呢? 需不需要做互補?
: 很多問題.......麻煩大家了
PI可以被FL2 and FL3 detected
somehow 也會影響FL1 (反之亦然)
但是請注意
EGFP/antiboy螢光的測定是Log mode
PI的測定則是用linear mode
需要注意的是FL2 channel(linear mode) 偵測到的FL1 (log mode)
確定FL1不會干擾你cell cycle的判讀
你可以做以下control
1. mouse spleenocytes with PI staining only
這是很好的cell cycle profile control
因為spleenocyte每一個stage的細胞都有
2. FITC/GFP only-> gate FITC/GFP+ cells-> display at FL2-A (linear mode)
看看peak 會出現在哪裡
應該不會干擾到才是
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如果我是你
我會想辦法sort EGFP+ and EGFP- cells
之後再固定起來看PI
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