[問題] 我的insert切不下來

看板Biotech (生命科學)作者 (照片能吃嗎?口去~)時間19年前 (2006/08/23 01:29), 編輯推噓2(202)
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不好意思,請高手幫幫我 1.就是我的目標基因 (insert,約400bp),接上T-A Vector, 送入E .coil中transform放大之後, 無法從T-A Vector 上切下來, 就無法把insert送去構築在我所想構築的另一個Vector上。 我是這樣做的: 有接inesrt(400bp)的T-A vector mini 取10λ ↓ 用Sma I 切(25度,4hr) total:30λ ↓ 做失活(80度,20min) 沈澱(total加到200λ,用phenol/chloroform,再用carrier+NaoAC+100%EtOH) 55度dry乾,溶ddH2O 23λ ↓ 用BanHI切/有添加BSA(37度,3hr) 23λ全下補到total:30λ ↓ 做失活(80度,20min) ↓ 跑gel 2λ (argarose,1%) 只出現一條>2000bp的band(因為我只用100bp maker) 並沒有400bp的band 註 T-A vector : 2728bp 我想請問: 1.為什麼我的insert切不下來? 我用Sma I 、BanHI的時間都有加長 大約一倍了 也做了失活 需要的buffer不同,也有用phenol/chloroform啊 T-A vector上也確實有Sma I 、BanHI的切位 我的inesrt也確定有接在T-A vector上(送過定序) 我該如何處理?該改進什麼地方? 我在酵素的海報(我忘記哪間公司,好像是NETBIO) 對照時發現Sma I 、BanHI交叉點是「連續切位」 請問這是什麼意思? 會造成digestion失敗嗎? 2.若之後順利切下後 構築時(一端stick/一端blunt)又如何提高ligation成功率? 該注意些什麼技巧? 專題作不出來 推徵眼看就要到 懇請善心人士幫我一下 感恩~~鞠躬~~~ -- 當人們開始盤算的時候 上天就笑了 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 220.131.222.191

08/23 01:40, , 1F
你要不要把topo分別用兩個酵素切看看阿 會不會是mut到
08/23 01:40, 1F

08/23 01:41, , 2F
digest site
08/23 01:41, 2F

08/23 12:33, , 3F
為啥切完還要做失活的動作及純化 直接跑電泳就好啦
08/23 12:33, 3F

08/23 12:34, , 4F
再從gel上elution 400 bp的片段就可以了
08/23 12:34, 4F
文章代碼(AID): #14wpyDTA (Biotech)
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