Re: [閒聊] 回到實驗台
※ 引述《StillRick (事情真多)》之銘言:
: 看到這件事情的風風雨雨,
: 回想自己以前寫實驗記錄本......相當不認真......
: 而且,重要的 Data 往是在異常忙碌的時候才生出來的
: (而忙碌的時候往往記錄就不太確實.......)
: 這次的事情讓我開始認真思考,
: raw data到底要保存到什麼樣的程度才算可接受
: 實驗記錄本要寫到什麼樣的程度才算可接受......
: 1. 以圖片檔來說:存JPEG檔可以嗎,TIFF檔就萬無一失嗎
: ,如果只微調過對比還可以算raw data嗎
我覺得 raw data就是要完全...沒動過的
像是 Zeiss 的 confocal image 有一種存檔模式是 .mdb
裡面所有圖片都是資料庫形式,
連幾點幾分,用哪顆鏡頭多少速度掃的都有紀錄,不可能進去改。(除非是電腦高手)
當然真正在用的時候,會 export 成 .tif檔
我覺得 .tif 可操作性滿大的
這種狀況下,上面的那種 .mdb 檔就很有價值
: 2. 以實驗記錄本來說:真的有實驗室會另外找見證人來簽名
: 證明這個實驗有做過嗎
我覺得意義不大 =.=
不如請別人幫忙重複實驗,更有公信力...如果是做同一個 project
: 3. 要publish的DATA,可以修圖嗎?
: (事實上,每一張要放在paper上的圖應該都修過吧......
: 尤其是螢光染色、細胞照片之類的,在紙上往往看不清楚的)
應該可以吧,修圖主要是兩種:強度跟對比
但是基本原則是,要修就是一整張圖一起修,就是說實驗組跟 control 組要一起修
而且要以 "基本上可逆的" 修圖過程為原則
如果調完對比,很多 signal 被調到 0 了,那麼就是不可逆的了
至於把 lane 移來移去的那種...還是在 load 的時候就想好吧
不然就是改成做統計圖,
影像圖的呈現應該要足夠忠實才對
另一個值得注意的地方是,任何影像圖最好在掃的時候包含 backgroud
不管是 confocal laser 或是掃瞄機,或是壓片選擇的時間
publish的時候可以把 background 講低,
但是自己留有原本的,含有 background 的 rawdata
: 4. 如果自己的實驗被人家抱怨,該怎麼樣回應?
: 如果對方是像Cell那樣等級的大頭跟怎麼樣處理比較好......
這種問題就要請 PI 級的來回答了:P
: 煩請版上神們指導阿~~~~~
: ※ 引述《midmoom (midmoom)》之銘言:
: : 這是感想文,
: : 不合適,會自刪。
: : the cell的事,無論如何的可惜,
: : 張老師已經做了決定,
: : 從這件事,
: : 學到了很多實驗室外的「知識」,
: : 很多從前不曾想過會發生的事,
: : 回到實驗室,好好的想一些原創的實驗,
: : 用新的數據、新的觀點,展現我們做研究的品味。
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: : 真正的戰場不是在這個版上
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天下最難的事,就是享受最簡單平凡的日子
而最簡單平凡的日子,往往是天下最單純的幸福
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◆ From: 140.109.32.9
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