找限制脢切位
我用引子上ncbi比對後
出來的不是我的菌株名 可是paper上是這樣寫的
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on
我用blastn比對序列 打primer上去(上面是網址 不會縮 報歉喔!!)
f:5'-agagtttgatcctggctcag-3'
r:5'-gctgcctcccgtaggagt-3'
出來的是他完整的基因序列
(確沒有paper上的E.coli，staphylococcus，streptococcus，kp等等)
那我在用搜尋 想找到我primer確實夾到的片段 大小約330bp)
該怎麼操作呢??
paper上菌株的accession number為NC 00913
不知道該如何用Acession number找出菌株呢?
那找這個PCR產物的限制脢切位點又該如何找呢??
我之前試過Alu 1 但切出來片段太小
想找到沒切出這麼多的
拜託板上高手了 拜托!
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