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Re: [問題] 什麼時候用NMR什麼時候用X-ray解結構？

看板Biotech (生命科學)作者 (工作中...)時間18年前 (2007/09/07 10:42), 編輯推噓6(6推 0噓 10→)
留言16則, 5人參與, 最新討論串2/6 (看更多)
※ 引述《VVVVii (aa)》之銘言： : 請問一下解結構時 : 什麼情況下要用NMR : 什麼情況要用X-ray呢？ : == : 我沒修過相關的課，這也不是作業 基本上，只要抓的到老鼠的（解的出結構）的都是好貓。 硬要分的話，大概以200個residue為一個模糊的界線吧， NMR較適用於解小蛋白質的結構，很少看過超過200 redidue的。 這個跟NMR圖譜的解析程度有關，residue數目太多訊號會疊在一起很難解。 X-ray就沒有這個問題了，只要晶體長的出來，resolution夠好一般都可以解出來。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.114.45.186
推
09/07 11:14, , 1F
意思是X-ray的解析度比NMR好?
09/07 11:14, 1F
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09/07 12:30, , 2F
記得老師說過醣蛋白不能用X-ray
09/07 12:30, 2F
推
09/07 13:30, , 3F
我對醣蛋白不熟，不過據我所知醣蛋白大部分是
09/07 13:30, 3F
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09/07 13:31, , 4F
membrane protein 結晶很困難，另外醣類分子的構形比
09/07 13:31, 4F
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09/07 13:33, , 5F
protein多太多了，要得到漂亮的晶體也不容易。
09/07 13:33, 5F
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09/07 13:35, , 6F
回e大，NMR並沒有解析度這個參數，所以也不能這麼說
09/07 13:35, 6F
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09/07 13:36, , 7F
NMR與X-ray各有優缺點，結構生物學的書會比較。
09/07 13:36, 7F
推
09/07 13:50, , 8F
NMR與X-ray各有一套評估解出結構的標準，基本上只要能
09/07 13:50, 8F
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09/07 13:51, , 9F
被RCSB PDB databank收進去的都結構沒什麼問題>
09/07 13:51, 9F
推
09/07 19:59, , 10F
X-ray並非晶體長的出來且解析度夠好就能解的出結構...
09/07 19:59, 10F
推
09/07 23:51, , 11F
去化學版問 會得到較多的回答
09/07 23:51, 11F
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09/07 23:53, , 12F
X ray來看 alpha helix較佳 NMR則是看 beta sheet較好
09/07 23:53, 12F
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09/07 23:54, , 13F
但NMR頂多只能看50kDa以下的蛋白 看不到disulfide bond
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09/07 23:56, , 14F
在晶體養的好的前提下 用XRD是首選 因為它只能看結構
09/07 23:56, 14F
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09/07 23:57, , 15F
卻解的很不錯 而NMR功能較廣 在生物分子上還能看dynamics
09/07 23:57, 15F
推
09/08 11:54, , 16F
感謝各位的回答<(_ _)>
09/08 11:54, 16F
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