Re: [問題] 什麼時候用NMR什麼時候用X-ray解結構?

看板Biotech (生命科學)作者 (暱稱小公主的!扣十分先)時間18年前 (2007/09/09 17:17), 編輯推噓3(303)
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就我所知的說一夏 我是化學所的生化組 我做的是蛋白研究 理論上而言 我盡可能希望獲的蛋白的NMR圖譜 因為NMR適用於水溶液的環境 對於bio而言 這點是非常重要的關鍵 因為僅有在這樣的條件下 才能說是看見蛋白在生物體中的真實結構 而X-Ray 在檢測前有個前提 就是必須養晶 無論是哪種蛋白 通常在養晶時必須加入一些重金屬作為晶核 或是與蛋白敖合形成晶種 即便有不加入重金屬而養晶的方式 都無法比NMR方式肯定的說 這是在生物體中較為真實的存在結構 但NMR檢測也是有缺點的 就是必須相較於X-Ray而言 必須要有相當程度的濃度才能檢測 而通常 我們盡可能使用N label (N同位素標定)的方式檢測 但是硬是要養出被同位素標記的蛋白通常都是不容易的 因為是屬於強迫性的方式供給菌種極為少量的養分 迫使菌種吸收同位素生產蛋白 因此產率通常都很低 此外 蛋白是種大型分子 因此通常低磁場的NMR圖譜是不能看的 在我的實驗室中 都是送到我學校的NMR 600MHz 貴儀中心進行2D NMR檢測 (國內學校單位有這樣的機型的不多見) 而X-Ray在樣品的製作上是容易的許多 解析通常也不錯 但是唯一為人所詬病的就是 這樣的結構並不是存在於水溶液環境底下的 --   (十字架)▕ 實┌───────┐(講台上) 耶穌問正在seminar的我   ▕ 驗│ ︿囧︿ 耶穌:小鬼,你混哪的?怎麼  ▔ ▕ 室│    比我被釘的還慘....? ╭──╮▕ 的└── ╱╲ ──┘╭──╮ 我 :主啊,我是研究所新生   ╭│偉大│▕ 人 ╔═══╗╭─│去死│     們=> ○●○●╰──╯▕ 們=> ○●○●○● ╰──╯ www.wretch.cc/album/ronall -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.120.9.11

09/09 17:50, , 1F
有疑問,膜蛋白呢?真正free的蛋白質並不多呀
09/09 17:50, 1F

09/09 22:22, , 2F
NMR與養晶的濃度通常都很高啊(>1mg/ml)
09/09 22:22, 2F

09/09 22:57, , 3F
這篇文章硬要說嚴謹度不太夠
09/09 22:57, 3F

09/09 22:59, , 4F
很明顯的對X-ray 解結構有些錯誤的認知..
09/09 22:59, 4F
※ 編輯: ronall 來自: 140.120.9.11 (09/10 00:08)

09/10 00:15, , 5F
抱歉~我所指的濃度是指養出NMR用15N label的難度(用詞不確)
09/10 00:15, 5F

09/10 00:16, , 6F
用詞不夠精確~這邊確實是我的疏忽ˊˋ
09/10 00:16, 6F
文章代碼(AID): #16uxelOL (Biotech)
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