Re: [求救] TA cloning一直失敗.....

看板Biotech (生命科學)作者 (颱風也喜歡放假)時間18年前 (2008/06/08 13:52), 編輯推噓4(403)
留言7則, 4人參與, 最新討論串2/3 (看更多)
我也用過同家公司的TOPO TA cloning 我做過的話2.2kb都是一次就成功了 都是直接照公司來的protocol做 所以我想你的1.8kb應該是很好接上去的 切膠回收的話我想你的PCR濃度就會降低 而且A' overhang也很容易掉 不過產物比較純..可以排除掉一些非major的雜band 之後做ligation transformation長出來的clone數明顯會比你直接用PCR的產物去做ligation的少 因為我之前也做過切膠回收跟直接做的 長出來的clone數真的差很多喔 我想你的問題很可能出在competent cell 因為我是用商品化的comptent cell 借其他人的comptent cell來做看看吧 或者借看看其他lab有沒有商品化的comptent cell做 因為我覺得competent cell做不好的話 會影響到你之後的transformation 我記得這組TA Cloning kit不便宜喔 相較之下用好ㄧ點的competent cell就很便宜了 ※ 引述《owl628 (owl628)》之銘言: : 我用的是invitrogen的TOPO TA Cloning : 用Tag P出我的要的片段,約1800b.p : 加4ul和1ul的salt solution及1ul的TA vector作用 : (22度西 30分鐘) ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^這邊的話我是放室溫30分鐘 : 接著用自己做的competent cell(DH5α)做CaCl2 transformation : 結果做了快10盤,不是沒長,就是長的colony抽不出質體 : (養的時候感覺菌液就不是很正常,有點稀) : 抗生素Ampicillin及Kanamycin都用過了 : 不知道有沒有人可以給我個建議,麻煩大家了 : 謝謝~ -- 愛情 -----世界上最不需要努力的事情 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 61.227.129.79 ※ 編輯: reteporeh 來自: 61.227.129.79 (06/08 14:00)

06/08 14:29, , 1F
Taq有proofreading嗎?有的話就不會有A
06/08 14:29, 1F

06/08 16:50, , 2F
Tag沒有,pfu才有.
06/08 16:50, 2F

06/08 17:00, , 3F
請問一下你的PCR產物是直接做ligation嗎???連PCR clean up
06/08 17:00, 3F

06/08 17:00, , 4F
都沒做嗎???謝謝~
06/08 17:00, 4F

06/08 21:31, , 5F
沒clean up出來的clone會很難挑吧...因為dNTP還蠻過量的
06/08 21:31, 5F

06/09 13:39, , 6F
恩..沒做..就直接ligation..fresh PCR product只取1ul
06/09 13:39, 6F

06/09 18:32, , 7F
補充一點.我PCR的產物很專一..所以才敢沒做回收就直接做
06/09 18:32, 7F
文章代碼(AID): #18ItEEb- (Biotech)
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