Re: [求救] TA cloning一直失敗.....
※ 引述《owl628 (owl628)》之銘言:
: 我用的是invitrogen的TOPO TA Cloning
: 用Tag P出我的要的片段,約1800b.p
: 加4ul和1ul的salt solution及1ul的TA vector作用
: (22度西 30分鐘)
: 接著用自己做的competent cell(DH5α)做CaCl2 transformation
: 結果做了快10盤,不是沒長,就是長的colony抽不出質體
: (養的時候感覺菌液就不是很正常,有點稀)
: 抗生素Ampicillin及Kanamycin都用過了
: 不知道有沒有人可以給我個建議,麻煩大家了
: 謝謝~
分享我個人的經驗。
我曾經做過一個TA cloning,一個月都做不出來。當時想怎麼可能?TA cloning從大學
做到碩士畢業,沒有上百也有數十次,只有colony的多寡,不可能會完全做不出來。
我當時遇到的情形是,比例調得再完美,再細心,就是沒有白色的colony,就算是藍色的
也很少。
這時候可能會覺得是transformation的問題或者是ligation的問題。
很不幸的我做了一個control,只有放vector加ligase去self ligation。實驗組就是
有加insert。結果是control組長滿了藍色的colony,實驗組只剩10顆藍色colony,白色
的只有1顆,抽出來check的結果也不是我要的大小。
為什麼呢?因為我放進去的fragment E.coli不喜歡。我猜你的東西八成是病毒的基因
或者是某個很重要的transmembrane protein才會遇到這種情形。
我的建議是,如果只是要用來送進mammalian cell表現,那你可以在你的fragment中間
加一個intron。也就是分成三步驟: 1. N terminal 2. intron 3. C terminal。
這種情形下以我朋友的經驗就可以做得出來了。
如果你是要用來純化protein.. 那你可能要考慮用yeast或者細胞去表現你的protein了。
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 61.56.130.95
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