Re: [求救]請問PCR products用restriction enzymeꐠ…
※ 引述《calmato (Anita~)》之銘言:
: ※ 引述《albertwang (會思考的魚)》之銘言:
: 不好意思~因為我是第一次接觸分生~很多東西都是自己try
: 或找資料或問人~所以有很多東西~不知該怎麼問或該注意什麼
: ~所以真的很不好意思~遇到很多問題卻自己一直沒法解決 >"<
: 廠商給的information 是只有說 To make 100uM stock solution
: add 255 ul of buffer
: 我的working primer是從這裡面取10ul primer + 90 ul water
: 那我把我的所有try的條件po上來~但不知道這樣是不是您說的反應條件?
: 跑PCR ,total volume 30,water 19.85,primer Forward and reverse
: 各1,10x dNTP 3,10xPCR buffer 3 ,Taq 0.15 ,Template DNA 2
: 以上單位都是ul。但我的DNA濃度品質不一~OD從 40~800 ng/ul
:
10x dNTP 3,Template DNA 2 這兩個可以少ㄧ點不過你已經可以做出來
那就不用改了不然出不來又麻煩了
使用restrition enzyme: PCR products 5,water 16.4,10x Buffer 2
: 50X SAM 0.6,enzyme 1;total volume 25,使用的廠牌是Fermentas
: 它的protocal是PCR reaction mixture 10ul(~0.1-0.5ug of DNA)
: water 18 ,10X Buffer Tango 2,50XSAM 0.6,enzyme 1-2
: 因為考量到我的PCR products加10會切不完整,~所以才加5,但照我的想法
: 我的DNA量不算太少,切出來應該會很清楚,但不知為何拍出來照片都很淡
: 我一直找不出原因。
: PCR products 5 這個體積是你純化過的體積還是pcr 後30ul取出來的體積
不過兩個情況都太少ㄧ點
除非你的product 粉濃
如果你怕切不完整那就加長切的時間依你加的enzyme 1
除非是相當特殊的不然16hr應該都還可以work
也想請問您剛說用酒精沉澱,是如何做呢?
: 以上很冗長,感謝您的指教!!
以上有一些問題鄉民回答的就不贅述(如buffer)
酒精沉澱 方法你可以到辜狗那找ㄧ下ㄧ定有
至於你這邊沒有交代
妳所run gel 的濃度是幾%
不過會出現太淡的話又想要和primer 分開
ㄧ個就是大於5%gel ㄧ個就是用長片(30cm)的gel如果貴實驗室沒有
那可以用跑protein page去做
然後用低伏特run
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