Re: [求救] X-光小角度散射圖解釋
※ 引述《goldfish0909 (金魚)》之銘言:
: 【問題】:
: X-光小角度散射圖解釋
: 【問題起因】:
: 文獻上的X-光小角度散射圖看不懂,無法解釋結果,樣品是蛋白質
: 【個人看法】:
: 看了英文解釋,只知道圖中的實體曲線是利用軟體預測出來的,空心圓圈是實際
: 實驗的圖,兩者趨勢相似,但三個圖中的橫坐標及縱座標單位分別代表的意思是
: 什麼? 以及圖形的趨勢要如呵解釋? 請有這方面專長的大大幫個忙,謝謝~~~~
: 以下是三個圖的連結:
: http://0rz.tw/M9xaD
: http://0rz.tw/4MumC
: http://0rz.tw/zeMw7
X-光小角度散射(SAXS)在生物物理方面
基本上是用x-ray來看protein的radius of gyration
第一張跟第三張一起講 因為是同一種圖
Y軸是intensity(counts)代表散射光強度
X軸 q= sin(theta)/lambda 為momentum transfer
基本上就是一個跟散射角有關的物理量
這種圖的profile會給你結構上的資訊
X軸上愈小的給在結構上愈大的資訊 例如protein的shape
再右邊一點就小一點 看fold...更右邊看atomic information
第二張圖 p(r)是electron pair distribution function
基本上是由圖一跟圖三這種scattering curve做複立葉轉換來的
這我不知道怎麼措詞比較好
看看下面這個例子應該比較簡單明瞭
http://scattering.tripod.com/calpr.html
當這個protein在做comformational change的時候
可以注意到此分布的變化
當兩個domain分開的時候 可以看到兩個peak
靠近的時候 會merge成一個peak
要知道SAXS基本原理的話書上找的到
我不是這方面的專家
更detail的再請板上的高手補充 :)
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