Re: [求救] X-光小角度散射圖解釋

看板Biotech (生命科學)作者zzxxzz (rara avis)時間16年前 (2009/07/29 07:31)推噓0(0推 0噓 1→)

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: X-光小角度散射(SAXS)在生物物理方面 : 基本上是用x-ray來看protein的radius of gyration : 第一張跟第三張一起講因為是同一種圖 : Y軸是intensity(counts)代表散射光強度 : X軸 q= sin(theta)/lambda 為momentum transfer : 基本上就是一個跟散射角有關的物理量因為週期性結構的qr=2π時干涉最明顯 q:入射角與折射角的向量差(nm^-1) r:兩原子之束縛電子間的距離(nm) 2π r=── q 所以儀器測得的q越小算出來的距離尺度越大大小 : 這種圖的profile會給你結構上的資訊 : X軸上愈小的給在結構上愈大的資訊例如protein的shape : 再右邊一點就小一點看fold...更右邊看atomic information : 第二張圖 p(r)是electron pair distribution function : 基本上是由圖一跟圖三這種scattering curve做複立葉轉換來的 : 這我不知道怎麼措詞比較好 : 看看下面這個例子應該比較簡單明瞭 : http://scattering.tripod.com/calpr.html : 當這個protein在做comformational change的時候 : 可以注意到此分布的變化 : 當兩個domain分開的時候可以看到兩個peak : 靠近的時候會merge成一個peak pair distance distribution function p(r) 包含兩個變數的積分: 1.r:定義同上 2.γ(r):各種r的出現機率所以連結動畫中分子打開成2個subunit時p(r)在長距離和短距離r機率都很高閉合球狀只在原子間距中距離的出現機率最高。 : 要知道SAXS基本原理的話書上找的到 : 我不是這方面的專家 : 更detail的再請板上的高手補充 :) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 115.43.9.24