[求救] Cloning

看板Biotech (生命科學)作者 (Fairy Monster)時間14年前 (2011/04/18 07:35), 編輯推噓6(6020)
留言26則, 11人參與, 最新討論串1/3 (看更多)
Hello, 大家早, 最近face到很annoy的問題, 我想了半天都想不出辦法來, 請大家幫忙解惑.. 實驗步驟大致上是這樣, 因為我的final construct have to be in pDM4 vector (7kb) 但是因為這傢伙很胖+copy number低, 所以我選擇先在pBluescript上做construct. 我的final produc in pBluescript 是3kb (2個片段+一個antibiotic marker(Tet)) 很不幸的, pBluescript也是3kb, 造成我無法用enzyme分開, (other enzyme in pBS lab沒有, 新訂enzyme是最後的辦法) 所以我的處理是用respected enzyme切後直接purified做ligation, 之後用double antibiotics marker selection. Tet(另外接進去的) and Cm which is the marker for pDM4, 這樣便可以殺掉self-ligation (指insert接回去pBS). 然後問題就來了! Transform後隔天有colony, colony PCR (pDM4 primer) is positive. 但我inoculate to liquid LB之後他就不長了, 但同樣的colony我restreak on new plate(2 antibiotics)就長得很開心, 試了兩次都這樣... very annoyed!!!!! 想請問大家有沒有碰過類似的問題以及有沒有建議的方法呢? 感謝大家憂^__________________________^ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 130.194.92.116

04/18 09:27, , 1F
只有我看不懂原po在寫什麼嗎...?
04/18 09:27, 1F

04/18 09:37, , 2F
我suggest你在養liduid的時候decrease抗生素to 1/2 or1/3量
04/18 09:37, 2F

04/18 09:48, , 3F
針對cloning,完成pBluescript的建構後,用M13 F+R和 pfu酵素
04/18 09:48, 3F

04/18 09:49, , 4F
作一次PCR再用限制酵素切就能得到你要的組合片段了
04/18 09:49, 4F

04/18 09:51, , 5F
pfu, M13 F+R primers 應該連隔壁實驗室都借得到...
04/18 09:51, 5F

04/18 12:42, , 6F
找看看有沒有pBluescript上有而insert沒有的RE切位
04/18 12:42, 6F

04/18 13:13, , 7F
中英文參雜個人認為不好閱讀 真正的專有名詞寫英文就夠
04/18 13:13, 7F

04/18 19:07, , 8F
謝謝大家...
04/18 19:07, 8F

04/18 19:13, , 9F
抱歉中英文參雜, 我想打中文, 可是我的中文快忘光了..
04/18 19:13, 9F

04/18 19:15, , 10F
起先我想打英文, 可是我想應該更少人會看吧
04/18 19:15, 10F

04/18 19:17, , 11F
抱歉造成閱讀困難.. 我下次用google翻譯好了
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04/18 19:18, , 12F
and, 我只是希望能解決問題, 並沒有其他的意思
04/18 19:18, 12F

04/19 01:04, , 13F
google翻譯會比現在更難閱讀唷 XD
04/19 01:04, 13F

04/19 01:59, , 14F
想建議你medium and plate去確認一下是否OK~
04/19 01:59, 14F

04/19 02:00, , 15F
liquid是完全不長還是長得不好?
04/19 02:00, 15F

04/19 02:01, , 16F
plate可以liquid不行,挺矛盾的....
04/19 02:01, 16F

04/19 02:06, , 17F
1.換E.coli strain, 2. 使用rich medium 再試試
04/19 02:06, 17F

04/19 07:15, , 18F
colony長在plate上和菌懸浮在LB裡面 抗生素實際作用濃度
04/19 07:15, 18F

04/19 07:16, , 19F
會有落差 液態裡面菌體分散 抗生素很容易抑制"每一個"菌
04/19 07:16, 19F

04/19 07:17, , 20F
菌體來不及生產兩種抗抗生素就會被殺死
04/19 07:17, 20F

04/19 07:18, , 21F
建議你plate上先用兩種抗生素篩選 挑出single colony後
04/19 07:18, 21F

04/19 07:19, , 22F
液態用你接進去的抗生素(Tet)一種就好
04/19 07:19, 22F

04/19 07:21, , 23F
液態用兩種的話濃度都減半 不然菌會長得很慢 甚至不長
04/19 07:21, 23F

04/19 07:38, , 24F
你有沒有辦法找到pbluescript有的但是target seq沒的RE site
04/19 07:38, 24F

04/19 07:39, , 25F
多切一種酵素 讓片段可以分開
04/19 07:39, 25F

04/25 05:04, , 26F
真好奇你是哪國人
04/25 05:04, 26F
文章代碼(AID): #1Dgtawrv (Biotech)
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